267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0737 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  100 
 
 
478 aa  957    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  54.82 
 
 
472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  45.76 
 
 
475 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  41.35 
 
 
466 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0243  lipopolysaccharide biosynthesis  41.37 
 
 
463 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  41.29 
 
 
461 aa  318  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  38.02 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  36.96 
 
 
472 aa  269  7e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1376  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.82 
 
 
465 aa  142  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  24.04 
 
 
779 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 
738 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  23.78 
 
 
755 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 
730 aa  123  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  26.26 
 
 
770 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25 
 
 
739 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  27.18 
 
 
727 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  21.86 
 
 
737 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  22.8 
 
 
711 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  27.35 
 
 
756 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  23.89 
 
 
745 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5360  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 
701 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445526  normal  0.0162612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  25.06 
 
 
472 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.15 
 
 
772 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  23.48 
 
 
797 aa  106  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 
764 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4961  exopolysaccharide transport protein family  25.1 
 
 
788 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184697  normal  0.0547536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  24.72 
 
 
734 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  25 
 
 
721 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  20.96 
 
 
872 aa  103  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  26.23 
 
 
733 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1537  GumC protein  26.47 
 
 
466 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1481  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 
467 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4528  non-specific protein-tyrosine kinase  26.82 
 
 
710 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.44176  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  22.2 
 
 
756 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 
463 aa  101  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4000  protein-tyrosine kinase  19.11 
 
 
708 aa  100  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.218918  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1961  non-specific protein-tyrosine kinase  25.63 
 
 
789 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.601973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  22.27 
 
 
743 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  24.46 
 
 
753 aa  96.7  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  25.74 
 
 
727 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 
643 aa  94  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 
748 aa  93.2  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  23.55 
 
 
737 aa  93.2  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 
745 aa  92.8  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  21.65 
 
 
726 aa  92.8  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  23.36 
 
 
756 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.76 
 
 
724 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1666  exopolysaccharide polymerization/transport protein  21.93 
 
 
747 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 
642 aa  88.2  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 
731 aa  88.6  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  22.27 
 
 
734 aa  86.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0308  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.96 
 
 
737 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1220  lipopolysaccharide biosynthesis  27.98 
 
 
789 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261863  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2561  putative succinoglycan biosynthesis transport protein ExoP  27.98 
 
 
771 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3243  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.15 
 
 
722 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.966104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  20.86 
 
 
756 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 
785 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389826  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3777  capsular exopolysaccharide family  22.32 
 
 
782 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  25.31 
 
 
820 aa  84.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1225  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.99 
 
 
724 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0867598  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  21.75 
 
 
790 aa  84  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0416  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme12  24.27 
 
 
729 aa  84  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  20.72 
 
 
742 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  24.36 
 
 
776 aa  83.2  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2982  exopolysaccharide transport protein family  22.79 
 
 
758 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3230  exopolysaccharide transport protein family  23.08 
 
 
758 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 
726 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.08 
 
 
739 aa  80.1  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  25.07 
 
 
740 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  24.17 
 
 
778 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0854  exopolysaccharide transport protein family  23.15 
 
 
709 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.298615 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
704 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  23.09 
 
 
722 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 
548 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  23.08 
 
 
499 aa  77  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4605  polysaccharide biosynthesis transporter  22.22 
 
 
763 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.599014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.85 
 
 
790 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  23 
 
 
499 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  24.78 
 
 
732 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1415  lipopolysaccharide biosynthesis  24.16 
 
 
715 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.836118 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  21.68 
 
 
736 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  20.74 
 
 
738 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5214  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 
774 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1810  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.85 
 
 
766 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.952814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25 
 
 
720 aa  74.7  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  22.6 
 
 
499 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  23.89 
 
 
772 aa  74.3  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  24.74 
 
 
766 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 
804 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 
776 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3369  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.56 
 
 
731 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.5 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  23 
 
 
518 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0181  non-specific protein-tyrosine kinase  22.59 
 
 
731 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 
710 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  22.99 
 
 
750 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3070  lipopolysaccharide biosynthesis  22.33 
 
 
500 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 
537 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>