155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3275 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
247 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  88.66 
 
 
247 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  62.75 
 
 
247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  62.35 
 
 
247 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  61.54 
 
 
247 aa  310  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  62.75 
 
 
247 aa  310  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  61.54 
 
 
247 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  61.13 
 
 
247 aa  304  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.5 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  44.09 
 
 
234 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.63 
 
 
221 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.09 
 
 
220 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.09 
 
 
220 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  40.45 
 
 
222 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  40.45 
 
 
222 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.75 
 
 
246 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  35.71 
 
 
232 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  36.49 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  33.93 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  34.26 
 
 
464 aa  135  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.89 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1678  chain length determinant protein  32.62 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1464  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  32.19 
 
 
247 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000744364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1491  chain length determinant protein  32.19 
 
 
247 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1609  chain length determinant protein  32.19 
 
 
247 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.78 
 
 
232 aa  122  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1646  chain length determinant protein  31.17 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1506  capsular polysaccharide biosynthesis protein  34.62 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.221865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3699  chain length determinant protein  30.77 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290655  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  32.88 
 
 
492 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.67 
 
 
482 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1435  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.85 
 
 
297 aa  111  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  26.38 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.66 
 
 
286 aa  106  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  29.29 
 
 
505 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  26.01 
 
 
466 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  26.94 
 
 
508 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  32.65 
 
 
230 aa  92.4  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 
480 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  29.65 
 
 
509 aa  88.6  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 
488 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.05 
 
 
454 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 
217 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  29.32 
 
 
503 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  26.74 
 
 
490 aa  85.9  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2856  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  24.43 
 
 
667 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  26.59 
 
 
624 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  31.84 
 
 
474 aa  80.9  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  42.39 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  38.98 
 
 
605 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  24.14 
 
 
496 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.82 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 
497 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  29.79 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  27.35 
 
 
463 aa  75.5  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12760  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.392937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4043  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.29 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.362631  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  29.68 
 
 
426 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3667  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  29.15 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  24.8 
 
 
521 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4007  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  25.98 
 
 
484 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3104  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466089  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2274  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 
315 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  31.2 
 
 
804 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  48.53 
 
 
730 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  26.01 
 
 
473 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 
431 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  28.87 
 
 
539 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  24.69 
 
 
529 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  36.05 
 
 
790 aa  62.4  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  34.04 
 
 
745 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  28.36 
 
 
525 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0165  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 
386 aa  61.2  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  38.36 
 
 
487 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2374  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 
230 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  38.27 
 
 
721 aa  58.9  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  27.51 
 
 
492 aa  58.9  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  23.14 
 
 
615 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  27.89 
 
 
453 aa  55.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  36.71 
 
 
764 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.66 
 
 
474 aa  55.1  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  26.02 
 
 
806 aa  53.5  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  32.47 
 
 
736 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  26.37 
 
 
711 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 
524 aa  52.4  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  21.18 
 
 
469 aa  52.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  36 
 
 
779 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  44.19 
 
 
527 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0342  protein-tyrosine kinase  23.05 
 
 
554 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0461311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0733  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 
429 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.511076  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  41.38 
 
 
499 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  30.1 
 
 
736 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22900  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 
278 aa  49.3  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  32.31 
 
 
756 aa  48.5  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  45.28 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>