92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2448 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
219 aa  434  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12760  capsular polysaccharide biosynthesis protein  54.37 
 
 
223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.392937  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  26.48 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.83 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 
464 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.35 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  28.11 
 
 
247 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 
232 aa  86.7  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  26.58 
 
 
234 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  28.44 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  28.9 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  27.52 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.49 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  28.11 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.9 
 
 
247 aa  82  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  30.35 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.77 
 
 
482 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  21.03 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  22.62 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  23.21 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1435  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.72 
 
 
297 aa  62.4  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.04 
 
 
474 aa  59.3  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  26.58 
 
 
492 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  27.27 
 
 
505 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1506  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.221865  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  20.47 
 
 
286 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  36.99 
 
 
445 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  28.82 
 
 
508 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  26.91 
 
 
454 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  35.48 
 
 
475 aa  51.6  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.23 
 
 
492 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2856  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  33.7 
 
 
741 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  22.87 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  22.87 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  23.65 
 
 
521 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  37.5 
 
 
711 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  35.29 
 
 
756 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  25.88 
 
 
466 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  39.39 
 
 
741 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.76 
 
 
643 aa  49.7  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.76 
 
 
642 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  32.39 
 
 
727 aa  48.9  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  34.78 
 
 
743 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.35 
 
 
720 aa  48.9  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  28.17 
 
 
806 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34.43 
 
 
730 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  33.73 
 
 
755 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  25.56 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  36.23 
 
 
747 aa  45.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  36.56 
 
 
759 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  35.44 
 
 
736 aa  45.1  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  23.53 
 
 
667 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0243  lipopolysaccharide biosynthesis  29.29 
 
 
463 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  32.31 
 
 
756 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0165  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 
386 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  30.99 
 
 
734 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 
804 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  25.82 
 
 
529 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  29.63 
 
 
753 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  32.84 
 
 
472 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  35.21 
 
 
757 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  41.33 
 
 
797 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0791  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.49 
 
 
653 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0449  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 
711 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3388  polysaccharide chain length determinant protein  29.58 
 
 
508 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.42 
 
 
726 aa  42.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  34.41 
 
 
740 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  31.08 
 
 
466 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.42 
 
 
726 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  26.42 
 
 
726 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 
431 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0737  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 
704 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.875761  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.42 
 
 
726 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.42 
 
 
726 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.99 
 
 
761 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.42 
 
 
726 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  26.42 
 
 
726 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1659  lipopolysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 
505 aa  42.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.490085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  31.51 
 
 
745 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  26.42 
 
 
726 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  23.4 
 
 
477 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1464  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  19.4 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000744364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1678  chain length determinant protein  19.4 
 
 
247 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  31.34 
 
 
747 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2359  capsular exopolysaccharide family  27.47 
 
 
794 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682984  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>