41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1584 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
431 aa  840    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  30.7 
 
 
490 aa  84.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  28.89 
 
 
667 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1820  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.29 
 
 
225 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00000660961  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  26.38 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  36.18 
 
 
473 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  28.14 
 
 
484 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
247 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  26.39 
 
 
508 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  31.03 
 
 
509 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  29.05 
 
 
525 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  27.24 
 
 
615 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  28.83 
 
 
503 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1405  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 
208 aa  61.6  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.148993  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  26.41 
 
 
524 aa  60.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.94 
 
 
463 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  26.79 
 
 
521 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 
220 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 
220 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  26.2 
 
 
222 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  26.2 
 
 
222 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  24.91 
 
 
529 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  26.67 
 
 
497 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 
453 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 
221 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  24.65 
 
 
222 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  25.13 
 
 
466 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  25.68 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3667  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 
229 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.25 
 
 
468 aa  46.6  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.17 
 
 
488 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2603  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.07 
 
 
204 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  26.89 
 
 
474 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  28.28 
 
 
492 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4043  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 
240 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.362631  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 
217 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2809  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.52 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3104  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 
229 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466089  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  27.52 
 
 
737 aa  43.9  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  26.84 
 
 
496 aa  43.5  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>