49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1506 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1506  capsular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
233 aa  472  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.221865  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1435  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.11 
 
 
297 aa  170  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.46 
 
 
286 aa  134  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.62 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.19 
 
 
247 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  34.07 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  34.96 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  33.63 
 
 
247 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  33.63 
 
 
247 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.74 
 
 
247 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  33.04 
 
 
247 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  28.7 
 
 
222 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  28.7 
 
 
222 aa  102  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.93 
 
 
230 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.84 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.84 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.58 
 
 
232 aa  79  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  21.92 
 
 
464 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  31.86 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  28.51 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  24.64 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  23.33 
 
 
232 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3699  chain length determinant protein  27.46 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290655  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  23.08 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.33 
 
 
482 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1646  chain length determinant protein  26.21 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  26.35 
 
 
474 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12760  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.392937  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1464  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  26.06 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000744364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1678  chain length determinant protein  26.06 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.78 
 
 
480 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0519  capsular exopolysaccharide family  30.53 
 
 
819 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  22.07 
 
 
463 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1609  chain length determinant protein  23.94 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1491  chain length determinant protein  23.94 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  22.13 
 
 
508 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  24.76 
 
 
496 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  22.97 
 
 
477 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  26.09 
 
 
624 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 
488 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  22.07 
 
 
237 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  28.57 
 
 
605 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  24.36 
 
 
723 aa  42.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  29.21 
 
 
509 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>