70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3405 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
246 aa  494  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.56 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.84 
 
 
247 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  36.8 
 
 
247 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  35.84 
 
 
247 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.75 
 
 
247 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  35.93 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  35.93 
 
 
247 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  34.63 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  29.86 
 
 
234 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.52 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.06 
 
 
482 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1464  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  25.2 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000744364  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  30.93 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  30.93 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1678  chain length determinant protein  24.8 
 
 
247 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1491  chain length determinant protein  24.39 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1609  chain length determinant protein  24.39 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1646  chain length determinant protein  23.87 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3699  chain length determinant protein  23.98 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290655  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.09 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  24.89 
 
 
492 aa  75.1  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  25.23 
 
 
230 aa  72  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  25.1 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  25.23 
 
 
464 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  23.53 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1506  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.03 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.221865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  24.67 
 
 
232 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  25.23 
 
 
477 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  23.24 
 
 
508 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  23.05 
 
 
466 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3104  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 
229 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466089  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.58 
 
 
435 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  24.27 
 
 
469 aa  52.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  21.71 
 
 
529 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  27.31 
 
 
474 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  24.6 
 
 
473 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2856  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1435  capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  19.82 
 
 
454 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  27.61 
 
 
438 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  24.22 
 
 
509 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0449  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.91 
 
 
711 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  23.11 
 
 
667 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  21.55 
 
 
496 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3667  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  24.58 
 
 
497 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4043  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.362631  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  22.97 
 
 
503 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  21.88 
 
 
521 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  20.18 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  24.24 
 
 
445 aa  46.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 
524 aa  45.8  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4007  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 
216 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  21.16 
 
 
253 aa  45.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.09 
 
 
778 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 
230 aa  45.4  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  22.17 
 
 
463 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2809  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 
405 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  29.21 
 
 
499 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2374  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.6 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4219  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.38 
 
 
685 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.52 
 
 
217 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>