219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2236 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  43.5 
 
 
234 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.5 
 
 
247 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.69 
 
 
247 aa  185  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.45 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  40.99 
 
 
247 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.44 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  40.09 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  40.09 
 
 
247 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  39.19 
 
 
247 aa  168  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  38.29 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  36.12 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  34.36 
 
 
232 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.12 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.59 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.27 
 
 
482 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  31.96 
 
 
464 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.91 
 
 
220 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.91 
 
 
220 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  31.86 
 
 
237 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  34.55 
 
 
222 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  34.55 
 
 
222 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  28.31 
 
 
222 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2856  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.8 
 
 
239 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  29.09 
 
 
492 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  38.85 
 
 
435 aa  99.4  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1435  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 
297 aa  99.4  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  29.38 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  26.32 
 
 
667 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.52 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.83 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  27.8 
 
 
466 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  26.94 
 
 
521 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  25.78 
 
 
505 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 
480 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  27.8 
 
 
253 aa  85.1  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  32.62 
 
 
474 aa  84.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  32.02 
 
 
503 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  29.07 
 
 
477 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  25 
 
 
529 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  26.22 
 
 
508 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  28.12 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12760  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.63 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.392937  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  27.95 
 
 
497 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  47.83 
 
 
445 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  23.66 
 
 
496 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  27.95 
 
 
525 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1678  chain length determinant protein  22.97 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1491  chain length determinant protein  22.97 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1464  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  22.97 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000744364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1609  chain length determinant protein  22.97 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  24.32 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  26.34 
 
 
509 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  27.23 
 
 
615 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2274  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.64 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.302253  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  27.11 
 
 
463 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  21.88 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.87 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 
488 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 
524 aa  69.7  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3699  chain length determinant protein  22.07 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1646  chain length determinant protein  22.32 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3667  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 
736 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1506  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.221865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4043  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.362631  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  28.9 
 
 
484 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  26.52 
 
 
473 aa  65.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 
453 aa  65.5  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4007  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.36 
 
 
474 aa  65.1  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  35.53 
 
 
711 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  24.15 
 
 
539 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  38.67 
 
 
790 aa  62.4  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  36.62 
 
 
730 aa  61.6  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  32.77 
 
 
624 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  33.33 
 
 
605 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  38.03 
 
 
779 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  37.66 
 
 
804 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  32.97 
 
 
737 aa  58.9  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.77 
 
 
642 aa  58.5  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  40.3 
 
 
472 aa  58.2  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.53 
 
 
730 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  32.61 
 
 
741 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  24.88 
 
 
469 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  27.39 
 
 
492 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  34.21 
 
 
745 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  32.91 
 
 
815 aa  55.5  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3104  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 
229 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466089  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  32.89 
 
 
732 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  32.04 
 
 
466 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  36.76 
 
 
472 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  28.33 
 
 
721 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2592  lipopolysaccharide biosynthesis  33.33 
 
 
790 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0789  lipopolysaccharide biosynthesis  50 
 
 
408 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  30.57 
 
 
426 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  28.57 
 
 
738 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  24.85 
 
 
757 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>