124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1069 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 230 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  53.04 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.48 
 
 		 482 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.3 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.45 
 
 		 464 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  32.87 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  32.58 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  32.87 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  32.13 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.55 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1506  capsular polysaccharide biosynthesis protein  33.93 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.221865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  29.06 
 
 		 232 aa  98.6  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  32.13 
 
 		 247 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  31.17 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.73 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  30.1 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1435  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.8 
 
 		 297 aa  95.1  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  30.25 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  30.58 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.16 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  31.93 
 
 		 521 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.13 
 
 		 247 aa  85.5  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.57 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.46 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  28.75 
 
 		 529 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12760  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.392937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  29.91 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  28.26 
 
 		 477 aa  75.5  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  29.07 
 
 		 484 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  27.19 
 
 		 492 aa  71.6  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  28.32 
 
 		 525 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  29.52 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  28.57 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1820  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00000660961  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  26.22 
 
 		 508 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  25.34 
 
 		 505 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 524 aa  66.2  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  26.91 
 
 		 509 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2856  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  25.75 
 
 		 667 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1464  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  24.88 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000744364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3699  chain length determinant protein  23.96 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1678  chain length determinant protein  24.88 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  26.79 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.75 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.89 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1491  chain length determinant protein  23.96 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1609  chain length determinant protein  23.96 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1646  chain length determinant protein  23.04 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  31.88 
 
 		 472 aa  58.9  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  39.53 
 
 		 736 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  40.54 
 
 		 711 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  32.53 
 
 		 743 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 480 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  37.5 
 
 		 475 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  23.77 
 
 		 466 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  34.83 
 
 		 721 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  40.85 
 
 		 478 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  28.34 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  34.78 
 
 		 756 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  23.64 
 
 		 496 aa  51.6  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  34.48 
 
 		 755 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0243  lipopolysaccharide biosynthesis  31.33 
 
 		 463 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  26.55 
 
 		 463 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  24.66 
 
 		 454 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3667  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  32.67 
 
 		 472 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  35.48 
 
 		 445 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  33.71 
 
 		 742 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  25.87 
 
 		 779 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  36.67 
 
 		 730 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.4 
 
 		 671 aa  49.3  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1372  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.97 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.482281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  27.65 
 
 		 753 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.57 
 
 		 435 aa  48.5  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.71 
 
 		 643 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  30.77 
 
 		 727 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.89 
 
 		 653 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.71 
 
 		 642 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.57 
 
 		 739 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  32.95 
 
 		 466 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  22.69 
 
 		 492 aa  46.2  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4786  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 519 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  32.05 
 
 		 750 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  38.03 
 
 		 753 aa  45.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.91 
 
 		 726 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.91 
 
 		 726 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.91 
 
 		 726 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  27.91 
 
 		 726 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.91 
 
 		 726 aa  45.1  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  39.22 
 
 		 743 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  32.39 
 
 		 737 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  27.91 
 
 		 726 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>