79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2688 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
220 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
220 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  52.04 
 
 
222 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  52.04 
 
 
222 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  40.99 
 
 
247 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  39.09 
 
 
247 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  39.46 
 
 
247 aa  148  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  38.84 
 
 
247 aa  148  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  38.57 
 
 
247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.12 
 
 
247 aa  145  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  37.67 
 
 
247 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  36.77 
 
 
247 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.91 
 
 
227 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  33.18 
 
 
234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.52 
 
 
221 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.57 
 
 
286 aa  96.3  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1506  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.84 
 
 
233 aa  91.7  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.221865  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 
246 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1464  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  30.67 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000744364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1678  chain length determinant protein  30.67 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  26.76 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.7 
 
 
232 aa  87  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1646  chain length determinant protein  29.78 
 
 
247 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1435  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  26.94 
 
 
464 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1609  chain length determinant protein  29.78 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1491  chain length determinant protein  29.78 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  26.76 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3699  chain length determinant protein  29.33 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290655  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  29.02 
 
 
230 aa  82  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  27.01 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  26.15 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12760  capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.392937  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.03 
 
 
482 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  24.86 
 
 
492 aa  65.1  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  25.11 
 
 
474 aa  62.8  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 
480 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  32.22 
 
 
472 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  26.32 
 
 
503 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  24.4 
 
 
454 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  22.58 
 
 
490 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 
431 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  22.03 
 
 
667 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  23.87 
 
 
466 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2856  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  24.43 
 
 
463 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  23.46 
 
 
469 aa  52.8  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  23.21 
 
 
484 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0165  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.8 
 
 
386 aa  51.2  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  44.23 
 
 
730 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  20.7 
 
 
492 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0149  chain length determinant protein  37.88 
 
 
472 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22388  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0737  chain length determinant protein  38.1 
 
 
478 aa  48.9  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  31.94 
 
 
737 aa  48.9  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  18.64 
 
 
496 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  23.61 
 
 
509 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  36.11 
 
 
736 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  22.54 
 
 
726 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  32.76 
 
 
741 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  34.38 
 
 
445 aa  45.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  26.11 
 
 
426 aa  45.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  35.71 
 
 
741 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2733  chain length determinant protein  27.94 
 
 
475 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1180  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 
507 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.56 
 
 
488 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  29.41 
 
 
815 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  31.03 
 
 
743 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  22.97 
 
 
525 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  23.21 
 
 
508 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  29.09 
 
 
521 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.17 
 
 
435 aa  42.4  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  33.33 
 
 
796 aa  42.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  29.33 
 
 
487 aa  42.4  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  20.83 
 
 
473 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 
524 aa  41.6  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>