257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0025 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0025  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 653 aa  1274    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.210943  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0659  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.35 
 
 		 671 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.62 
 
 		 643 aa  231  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.67 
 
 		 642 aa  226  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.38 
 
 		 720 aa  203  9e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0945  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 625 aa  140  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22220  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  27.43 
 
 		 734 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 		 463 aa  109  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  24.3 
 
 		 736 aa  94  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2029  lipopolysaccharide biosynthesis  22.62 
 
 		 518 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.911023  normal  0.105361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  21.39 
 
 		 743 aa  92  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  24.24 
 
 		 745 aa  91.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  21.37 
 
 		 739 aa  90.5  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  22.97 
 
 		 741 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  22.86 
 
 		 753 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 804 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  22.01 
 
 		 756 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.6 
 
 		 790 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1340  tyrosine-protein kinase, putative  20.17 
 
 		 820 aa  82.4  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1712  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.48 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.661952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  21.19 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  29.63 
 
 		 755 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0978  lipopolysaccharide biosynthesis  21.95 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  22.31 
 
 		 755 aa  75.1  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5769  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 778 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  22.32 
 
 		 802 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0282  polysaccharide chain length determinant protein  20.21 
 
 		 511 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1116  lipopolysaccharide biosynthesis  20.94 
 
 		 741 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0704492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3532  exopolysaccharide biosythesis protein PslE  21.07 
 
 		 663 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.393187  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3281  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  19.79 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.308326  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 		 738 aa  70.1  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2588  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 520 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 664 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0126149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3127  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0147  lipopolysaccharide biosynthesis  20.13 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0065  capsular exopolysaccharide family  21.59 
 
 		 795 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02221  hypothetical protein  24.86 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2477  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  27.08 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  26.83 
 
 		 740 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  21.13 
 
 		 806 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  21.61 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1770  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  22.65 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  21.15 
 
 		 711 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  22.86 
 
 		 742 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2728  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.62 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898945  normal  0.954078 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2506  polysaccharide chain length determinant protein, PEP-CTERM locus subfamily  19.09 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.882544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  21.8 
 
 		 872 aa  64.7  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2964  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.53 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  19.5 
 
 		 750 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  32.48 
 
 		 747 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.58 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  20.67 
 
 		 406 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  20.99 
 
 		 753 aa  63.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  26.67 
 
 		 740 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  21.36 
 
 		 763 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1169  lipopolysaccharide biosynthesis  21.81 
 
 		 527 aa  63.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2918  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 		 522 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732193  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  23.21 
 
 		 736 aa  62  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  25.86 
 
 		 764 aa  62  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  25.61 
 
 		 740 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003540  chain length determinant protein  23.89 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3388  polysaccharide chain length determinant protein  22.43 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1984  lipopolysaccharide biosynthesis  22.02 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2153  capsular exopolysaccharide family  21.62 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3508  polysaccharide chain length determinant protein  21.98 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047598 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  21.74 
 
 		 734 aa  61.2  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3006  hypothetical protein  22.3 
 
 		 662 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0885595  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  27.87 
 
 		 748 aa  60.8  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2580  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.56 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4163  lipopolysaccharide biosynthesis  19.81 
 
 		 748 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.214287  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4203  lipopolysaccharide biosynthesis  19.81 
 
 		 748 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3313  lipopolysaccharide biosynthesis protein  19.81 
 
 		 735 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1878  lipopolysaccharide biosynthesis  19.88 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.950622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0133  hypothetical protein  22.32 
 
 		 507 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2688  lipopolysaccharide biosynthesis  22.89 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  22.46 
 
 		 772 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.08 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.704444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  22.22 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2391  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 530 aa  58.9  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.64 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 730 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  22.78 
 
 		 757 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35690  hypothetical protein  21.83 
 
 		 662 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0001855  hitchhiker  6.19031e-17 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  30.43 
 
 		 753 aa  58.2  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2398  lipopolysaccharide biosynthesis  23.88 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0820285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5924  exopolysaccharide polymerization/transport protein  19.76 
 
 		 778 aa  57.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3191  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.12 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2528  lipopolysaccharide biosynthesis  22.41 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.597062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1521  lipopolysaccharide biosynthesis  23.71 
 
 		 514 aa  56.6  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3125  capsular exopolysaccharide family protein  20.99 
 
 		 743 aa  56.6  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.858566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  22.22 
 
 		 797 aa  57  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0659  lipopolysaccharide biosynthesis  20.91 
 
 		 524 aa  57  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413741  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  20.92 
 
 		 746 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01392  exopolysaccharide xanthan biosynthesis chain length determinant protein GumC  20.41 
 
 		 472 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.402956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  19.67 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1135  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 745 aa  56.2  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>