94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2652 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 222 aa  441  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.53 
 
 		 221 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  36.49 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  35.91 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.91 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.73 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  31.19 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  31.65 
 
 		 247 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  31.19 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  30.73 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  27.73 
 
 		 464 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  30.56 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.36 
 
 		 482 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  33.48 
 
 		 454 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  28.57 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  27.88 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.1 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.22 
 
 		 480 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0918  capsule chain length determinant protein  25.12 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000182566  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  27.27 
 
 		 492 aa  88.2  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  25.11 
 
 		 667 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2448  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.78 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0667575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2856  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.27 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  28.14 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  28.25 
 
 		 509 aa  82.4  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  27.43 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  26.67 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  26.67 
 
 		 505 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12760  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.392937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0140  MPA1 family polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0135  MPA1 family polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  25.89 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 488 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1506  capsular polysaccharide biosynthesis protein  28.51 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.221865  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2745  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2688  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  25.56 
 
 		 615 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  25.78 
 
 		 497 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  24.22 
 
 		 503 aa  68.6  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1435  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 297 aa  68.2  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  26.32 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  27.31 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  25.12 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  22.87 
 
 		 490 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  37.25 
 
 		 624 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1646  chain length determinant protein  24.55 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3699  chain length determinant protein  24.55 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1663  lipopolysaccharide biosynthesis  34.78 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.861892  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  24.12 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  30.94 
 
 		 605 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1464  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  23.85 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000744364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1678  chain length determinant protein  23.85 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  24.34 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1491  chain length determinant protein  23.39 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.303554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1609  chain length determinant protein  23.39 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.17 
 
 		 468 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  41.43 
 
 		 745 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  23.58 
 
 		 463 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.05 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 492 aa  51.6  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2347  lipopolysaccharide biosynthesis  28.19 
 
 		 426 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000937745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 		 524 aa  49.3  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 453 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 431 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  21.97 
 
 		 484 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  35.11 
 
 		 736 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3104  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  23.38 
 
 		 477 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  37.96 
 
 		 753 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  32.29 
 
 		 756 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  26.51 
 
 		 443 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3667  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 		 804 aa  45.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2880  lipopolysaccharide biosynthesis  27.27 
 
 		 487 aa  45.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4043  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.362631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  32.89 
 
 		 743 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  31.88 
 
 		 790 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  26.19 
 
 		 527 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  24.62 
 
 		 711 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  30.88 
 
 		 806 aa  43.5  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  21.43 
 
 		 472 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  25.2 
 
 		 755 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  27.94 
 
 		 724 aa  42.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  29.59 
 
 		 770 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  23.53 
 
 		 872 aa  42  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  22.61 
 
 		 737 aa  42  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22900  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 278 aa  42  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  29.33 
 
 		 747 aa  41.6  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  32.43 
 
 		 755 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>