48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1820 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1820  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 225 aa  437  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00000660961  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  36.87 
 
 		 503 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  30.35 
 
 		 508 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  30.5 
 
 		 667 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  34.13 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  35.59 
 
 		 615 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  31.82 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  30.05 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  30.85 
 
 		 463 aa  78.6  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  30.29 
 
 		 525 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  30 
 
 		 466 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  29.28 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.29 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  30.29 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  31.55 
 
 		 492 aa  72.4  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  28.74 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  30 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  31.43 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  31.67 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1069  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.62909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  31.87 
 
 		 490 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  26.37 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  32.46 
 
 		 453 aa  65.5  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  28.74 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  29.72 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  29.79 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0540  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.82 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  29.07 
 
 		 492 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  28.18 
 
 		 443 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  25.73 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0949  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.51 
 
 		 561 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323077  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  25.15 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  25.15 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1173  cpsC protein  22.41 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  37.93 
 
 		 757 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  25 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  30.39 
 
 		 469 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  20 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.35 
 
 		 468 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  33.85 
 
 		 472 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2374  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.92 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  21.08 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3269  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.72 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.316861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3104  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1156  capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 286 aa  41.6  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000219434  hitchhiker  4.797860000000001e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>