More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0393 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 468 aa  900    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  31.91 
 
 		 474 aa  162  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  30.8 
 
 		 505 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  31.53 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  31.03 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  30.91 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  31.26 
 
 		 496 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  30.71 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  30.58 
 
 		 490 aa  147  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  30.49 
 
 		 667 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  32.21 
 
 		 525 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  31.58 
 
 		 509 aa  136  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.41 
 
 		 454 aa  136  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  32.79 
 
 		 473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  31.21 
 
 		 472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  29.43 
 
 		 497 aa  127  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.32 
 
 		 463 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  31.51 
 
 		 615 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  26.92 
 
 		 529 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2887  capsular exopolysaccharide family  30.41 
 
 		 438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  31.12 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  26.81 
 
 		 521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  33.49 
 
 		 492 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.75 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  21.81 
 
 		 464 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  29.49 
 
 		 524 aa  104  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  26.3 
 
 		 779 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  29.55 
 
 		 443 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1977  capsular exopolysaccharide family  33.82 
 
 		 803 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664452 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  24.83 
 
 		 492 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  29.63 
 
 		 711 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  29.12 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4101  hypothetical protein  33 
 
 		 722 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.965422  normal  0.2163 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  32 
 
 		 803 aa  80.9  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  26.78 
 
 		 756 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  25.33 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 804 aa  77  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6398  capsular exopolysaccharide family  25.19 
 
 		 775 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0452  chain length determinant protein  22.83 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000687641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  25.75 
 
 		 539 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6307  capsular exopolysaccharide family  22.15 
 
 		 772 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.6836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0464  capsule chain length determinant protein  23.87 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000492666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4355  capsular exopolysaccharide family  25.39 
 
 		 767 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672208  normal  0.663682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  25.09 
 
 		 747 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  23.68 
 
 		 790 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  31.95 
 
 		 784 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  23.78 
 
 		 726 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  24.83 
 
 		 783 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  22.65 
 
 		 815 aa  70.5  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  31.47 
 
 		 747 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  30.99 
 
 		 745 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29900  Protein-tyrosine kinase wzz family protein  26.84 
 
 		 734 aa  70.5  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.39 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  26.06 
 
 		 741 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  30.96 
 
 		 746 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  26.23 
 
 		 734 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  28.95 
 
 		 575 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6487  hypothetical protein  33.12 
 
 		 781 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.907329 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  24.76 
 
 		 234 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  25.43 
 
 		 753 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  25.47 
 
 		 746 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.46 
 
 		 736 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1010  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.42 
 
 		 599 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1122  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.12 
 
 		 780 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  26.19 
 
 		 743 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0736  tyrosine kinase  28.49 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 764 aa  67.8  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  29.28 
 
 		 784 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22230  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.61 
 
 		 217 aa  67  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  26.04 
 
 		 740 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 217 aa  67  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1585  non-specific protein-tyrosine kinase  22.26 
 
 		 724 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.51 
 
 		 247 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  23.29 
 
 		 740 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  31.4 
 
 		 802 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4428  non-specific protein-tyrosine kinase  29.11 
 
 		 749 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  27.24 
 
 		 755 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  25.38 
 
 		 217 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  26.28 
 
 		 734 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.61 
 
 		 739 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4095  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.28 
 
 		 730 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  32.43 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  25.37 
 
 		 741 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  22.89 
 
 		 770 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  24.07 
 
 		 750 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  24.91 
 
 		 738 aa  64.3  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  20.72 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  21.91 
 
 		 756 aa  63.9  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.88 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  22.61 
 
 		 727 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1179  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  21.53 
 
 		 786 aa  63.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0436  capsular polysaccharide transport protein, putative  26.12 
 
 		 822 aa  63.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0397747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1820  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.65 
 
 		 225 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00000660961  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5359  protein-tyrosine kinase  32.37 
 
 		 800 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4089  capsular exopolysaccharide family  24.9 
 
 		 759 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286783 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  21.03 
 
 		 806 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  25.07 
 
 		 746 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>