49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3104 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3104  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2374  lipopolysaccharide biosynthesis protein  79.04 
 
 		 230 aa  360  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3578  diguanylate cyclase  34.52 
 
 		 367 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  28.36 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  28.79 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3275  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000161203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3388  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4108  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1944  lipopolysaccharide biosynthesis  29.14 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3001  lipopolysaccharide biosynthesis  28.64 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  28.36 
 
 		 667 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  26.73 
 
 		 496 aa  61.6  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  28.29 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  27.88 
 
 		 466 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3667  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  26.7 
 
 		 508 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3405  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.16 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000403429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2856  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.11 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  29.91 
 
 		 503 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4043  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.362631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1003  capsular exopolysaccharide family  25.98 
 
 		 477 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0165015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.05 
 
 		 463 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  24.41 
 
 		 454 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 		 480 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  25.84 
 
 		 473 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5397  capsular polysaccharide biosynthesis  25.63 
 
 		 247 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5452  chain length regulator  23.5 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5399  chain length determinant protein  24.26 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0873019  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  27.57 
 
 		 539 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2652  lipopolysaccharide biosynthesis  23.36 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5553  capsular polysaccharide biosynthesis  24.63 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000105771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2474  lipopolysaccharide biosynthesis  32.39 
 
 		 499 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5074  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 247 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.9 
 
 		 488 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1180  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 		 507 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  41.3 
 
 		 804 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4959  chain length regulator (capsular polysaccharide biosynthesis)  24 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000799386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  40.43 
 
 		 790 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  31.29 
 
 		 497 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1584  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 431 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1820  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00000660961  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  24.45 
 
 		 529 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  24.26 
 
 		 490 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0393  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.49 
 
 		 468 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  29.6 
 
 		 352 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  24.73 
 
 		 509 aa  42  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  25.98 
 
 		 484 aa  41.6  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1984  polysaccharide chain length determinant protein, putative  31.43 
 
 		 490 aa  41.6  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>