More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0402 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  100 
 
 		 352 aa  676    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  61.75 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5018  ABC transporter membrane spanning protein (iron (III))  55.66 
 
 		 327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  55.15 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  51.67 
 
 		 336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  51.9 
 
 		 343 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  47.63 
 
 		 346 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  50.64 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26360  putative permease of ABC transporter  51.9 
 
 		 343 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  47.63 
 
 		 347 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0869  transport system permease protein  51.25 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1350  transport system permease protein  51.25 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1415  iron compound ABC transporter, permease protein  45.83 
 
 		 366 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  44.41 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4492  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  50.72 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1332  transport system permease protein  45.99 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200312 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  45.25 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3190  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  51.59 
 
 		 371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2033  iron compound ABC transporter, permease protein  45.35 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.409984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2715  iron chelate ABC transporter permease protein  51.59 
 
 		 371 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1895  iron chelate ABC transporter permease protein  45.35 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3151  iron chelate ABC transporter permease protein  45.35 
 
 		 371 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0881  iron chelate ABC transporter permease protein  51.59 
 
 		 371 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.626277  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.56 
 
 		 367 aa  242  7.999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3206  FecCD-family membrane transporter protein  45.07 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  45.11 
 
 		 363 aa  239  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  40.71 
 
 		 350 aa  236  4e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  44.16 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  39.26 
 
 		 351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5059  transport system permease protein  45.66 
 
 		 358 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.344774 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  41.25 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.48 
 
 		 334 aa  226  6e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.48 
 
 		 334 aa  226  6e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3575  transport system permease protein  43.93 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  38.94 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0185  transport system permease protein  42.99 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2770  transport system permease protein  44.96 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169159  normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  38.62 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  44.31 
 
 		 353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0713  transport system permease protein  41.56 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0173  transport system permease protein  42.19 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  44.41 
 
 		 338 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  41.25 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  40.38 
 
 		 336 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  38.74 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0761  iron-compound ABC transporter, permease protein  39.83 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  42.45 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  44.37 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  41.77 
 
 		 360 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3735  transport system permease protein  38.28 
 
 		 376 aa  205  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.864655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1140  transport system permease protein  43 
 
 		 340 aa  206  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04380  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.31 
 
 		 389 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  37.9 
 
 		 353 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  41.61 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  39.31 
 
 		 356 aa  202  9e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  39.01 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.68 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  43.03 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  43.26 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  37.83 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1034  iron-compound ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  35.82 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  38.68 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  37.31 
 
 		 346 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  37.39 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  45.36 
 
 		 350 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  40.63 
 
 		 345 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  36.41 
 
 		 364 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  40.12 
 
 		 452 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  40.61 
 
 		 345 aa  199  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  36.68 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0546  transport system permease protein  43.42 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  40 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  39.04 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  36.9 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  36.14 
 
 		 364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  38.51 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  40.34 
 
 		 372 aa  196  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  34.82 
 
 		 336 aa  196  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  38.36 
 
 		 375 aa  196  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  39.51 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2248  transport system permease protein  42.55 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  34.81 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  37.54 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 335 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  37.11 
 
 		 370 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  38.73 
 
 		 340 aa  193  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  39.66 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0442  transport system permease protein  41.53 
 
 		 356 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  38.46 
 
 		 349 aa  192  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  37.78 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  38.66 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  36.81 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  38.01 
 
 		 353 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  40.93 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  35.83 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3279  transport system permease protein  36.95 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  39.76 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  39.24 
 
 		 354 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  34.45 
 
 		 355 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>