More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04380 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04380  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  100 
 
 		 389 aa  728    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  59.26 
 
 		 367 aa  362  6e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  48.1 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  43.9 
 
 		 334 aa  243  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  50.53 
 
 		 350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  47.26 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  39.26 
 
 		 350 aa  234  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  50 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  45.24 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  48.91 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  45.57 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  43.85 
 
 		 352 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  41.11 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  44.24 
 
 		 353 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  41.77 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1332  transport system permease protein  45.99 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26360  putative permease of ABC transporter  49.68 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1415  iron compound ABC transporter, permease protein  45.4 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0869  transport system permease protein  45.07 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1350  transport system permease protein  45.07 
 
 		 346 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  38.98 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.66 
 
 		 363 aa  218  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1969  transport system permease protein  44.16 
 
 		 376 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.865117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4492  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  45.07 
 
 		 346 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3206  FecCD-family membrane transporter protein  45 
 
 		 371 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  45.28 
 
 		 347 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3190  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2715  iron chelate ABC transporter permease protein  45 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0881  iron chelate ABC transporter permease protein  45 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.626277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  43.81 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3151  iron chelate ABC transporter permease protein  45 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.23 
 
 		 330 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4276  transport system permease protein  45.15 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2033  iron compound ABC transporter, permease protein  45.17 
 
 		 352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.409984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1895  iron chelate ABC transporter permease protein  45.17 
 
 		 352 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273368  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.73 
 
 		 330 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  47.81 
 
 		 353 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.38 
 
 		 363 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  46.93 
 
 		 361 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  45.54 
 
 		 340 aa  209  6e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  42.81 
 
 		 353 aa  209  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  44.62 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  42.59 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  41.95 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  41.33 
 
 		 381 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  41.04 
 
 		 367 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  44.93 
 
 		 352 aa  206  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.17 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.17 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  42.59 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  46.67 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  45.61 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  42.64 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0442  transport system permease protein  45.14 
 
 		 356 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  43.25 
 
 		 345 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  39.93 
 
 		 362 aa  202  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  43.73 
 
 		 360 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  41.72 
 
 		 340 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  42.03 
 
 		 346 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  43.27 
 
 		 338 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  36.47 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  44.34 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  40.62 
 
 		 356 aa  196  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  39.22 
 
 		 361 aa  196  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.69 
 
 		 337 aa  195  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  39.18 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0757  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  38.3 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.534132  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  42.23 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  43.69 
 
 		 348 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  37.69 
 
 		 375 aa  193  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  41.08 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  39.63 
 
 		 336 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1165  putative vitamin B12 transport system permease protein BtuC  38.99 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.320828  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  42.22 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  38.27 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  39.43 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  42.16 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  39.81 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0704  iron compound ABC transporter, permease protein  45.61 
 
 		 328 aa  190  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17620  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.67 
 
 		 354 aa  189  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  36.81 
 
 		 351 aa  189  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  32.28 
 
 		 373 aa  189  9e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  38.7 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  42.64 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  36.97 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0755  iron compound ABC transporter, permease protein  45.61 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  44.1 
 
 		 358 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  38.4 
 
 		 375 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  41.97 
 
 		 361 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  36.97 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  34.17 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  40.24 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5059  transport system permease protein  46.96 
 
 		 358 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.344774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1034  iron-compound ABC transporter, permease protein  39.16 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  34.66 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1137  transport system permease protein  43.45 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2583  transport system permease protein  42.72 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5018  ABC transporter membrane spanning protein (iron (III))  42.07 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>