More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3203 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  100 
 
 
350 aa  681    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  44.75 
 
 
336 aa  296  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  44.13 
 
 
354 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  42.14 
 
 
358 aa  258  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  41.88 
 
 
356 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  45.99 
 
 
315 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  39.46 
 
 
354 aa  239  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  40.43 
 
 
330 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  39.42 
 
 
361 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  40.74 
 
 
330 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  38.48 
 
 
337 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  37.46 
 
 
346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  42.58 
 
 
345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  39.24 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.47 
 
 
355 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1075  putative iron transporter, membrane component  40.99 
 
 
347 aa  229  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  41.41 
 
 
363 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  41.9 
 
 
338 aa  226  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  40.57 
 
 
338 aa  225  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  47.86 
 
 
373 aa  224  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  37.43 
 
 
353 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  42.65 
 
 
325 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  41.82 
 
 
363 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  38.18 
 
 
367 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  37.95 
 
 
351 aa  222  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  37.21 
 
 
452 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  39.88 
 
 
340 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  38.57 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  36.25 
 
 
368 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  40.38 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  40.4 
 
 
380 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.06 
 
 
371 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  37.58 
 
 
370 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  37.79 
 
 
351 aa  215  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  41.01 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  41.01 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  41.01 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  44.29 
 
 
342 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1214  transport system permease protein  40.97 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  41.01 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  43.57 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  35.82 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  36.5 
 
 
340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  41.28 
 
 
325 aa  213  5.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 
342 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  37.24 
 
 
387 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  43.57 
 
 
342 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  44.93 
 
 
315 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  40.91 
 
 
330 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  41.61 
 
 
360 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  39.38 
 
 
341 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  38.3 
 
 
331 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.02 
 
 
334 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  35.67 
 
 
347 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  34.73 
 
 
368 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.51 
 
 
334 aa  208  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.51 
 
 
334 aa  208  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  40.21 
 
 
369 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  35.48 
 
 
360 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  37.72 
 
 
361 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  38.98 
 
 
334 aa  206  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  38.98 
 
 
334 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  38.98 
 
 
334 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  38.06 
 
 
346 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  37.33 
 
 
330 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  42.4 
 
 
367 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  36.94 
 
 
351 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  39.39 
 
 
353 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  34.49 
 
 
338 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  37.33 
 
 
318 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  35.42 
 
 
348 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  36.68 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  35.84 
 
 
355 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  37.19 
 
 
357 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  34.26 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  43.97 
 
 
347 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  42.71 
 
 
376 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  40.21 
 
 
345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  35.07 
 
 
338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  40.89 
 
 
358 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  39.93 
 
 
356 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  36.12 
 
 
372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.41 
 
 
390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  36.28 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  37.22 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  36.66 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  38.39 
 
 
337 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  37.06 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.76 
 
 
343 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2441  transport system permease protein  38.85 
 
 
342 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00106696  normal  0.535476 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  39.19 
 
 
350 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2792  corrinoid ABC transporter permease  45.23 
 
 
362 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.525724  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  34.81 
 
 
365 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  38.63 
 
 
348 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  35.99 
 
 
352 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  34.09 
 
 
368 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  35.05 
 
 
350 aa  194  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  38.33 
 
 
370 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  39.93 
 
 
361 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>