More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2100 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  100 
 
 		 334 aa  635    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  56.7 
 
 		 351 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  51.86 
 
 		 360 aa  292  7e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  51.04 
 
 		 381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  54.52 
 
 		 353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5059  transport system permease protein  53.04 
 
 		 358 aa  272  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.344774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.61 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  51.83 
 
 		 361 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  46.73 
 
 		 350 aa  262  6e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  45.51 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  48.74 
 
 		 340 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  43.81 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  47.39 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  42.68 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26360  putative permease of ABC transporter  46.73 
 
 		 343 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  46.2 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  45.59 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5018  ABC transporter membrane spanning protein (iron (III))  43.98 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  42.51 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  46.48 
 
 		 351 aa  232  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  45.43 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  42.9 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  45.37 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  41.12 
 
 		 363 aa  226  6e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0869  transport system permease protein  41.82 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1350  transport system permease protein  41.82 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  43.3 
 
 		 341 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  40.81 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  41.72 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  44.04 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1332  transport system permease protein  41.21 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4492  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  41.82 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  41.01 
 
 		 347 aa  219  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2033  iron compound ABC transporter, permease protein  49.12 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.409984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1895  iron chelate ABC transporter permease protein  49.12 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.273368  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3735  transport system permease protein  42.43 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.864655 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2715  iron chelate ABC transporter permease protein  49.12 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0881  iron chelate ABC transporter permease protein  49.12 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.626277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  38.1 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3151  iron chelate ABC transporter permease protein  49.12 
 
 		 371 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  46.18 
 
 		 352 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  41.12 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  41.12 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3190  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.76 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  44.33 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3206  FecCD-family membrane transporter protein  48.76 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  44.33 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  44.17 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  43.26 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  43.26 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  43.26 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1415  iron compound ABC transporter, permease protein  43.58 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  41.81 
 
 		 370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  43.26 
 
 		 345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  43.26 
 
 		 345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  43.26 
 
 		 342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  38.66 
 
 		 332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  43.26 
 
 		 345 aa  212  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  43.26 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  41.64 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1034  iron-compound ABC transporter, permease protein  40.84 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4085  transport system permease protein  43.55 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0185  transport system permease protein  40.18 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  45.77 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2962  transport system permease protein  40.17 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3365  transport system permease protein  40.06 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  38.02 
 
 		 350 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  42.86 
 
 		 369 aa  209  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1010  transport system permease protein  40.06 
 
 		 364 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0704  iron compound ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  43.55 
 
 		 368 aa  209  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  40.32 
 
 		 357 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3575  transport system permease protein  40.94 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0173  transport system permease protein  39.88 
 
 		 336 aa  209  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04380  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.9 
 
 		 389 aa  209  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0755  iron compound ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0976  transport system permease protein  38.87 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3181  transport system permease protein  43.17 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  42.77 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  39.33 
 
 		 383 aa  205  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  39.81 
 
 		 345 aa  205  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  42.95 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 		 335 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  41.85 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  38.65 
 
 		 353 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  44.52 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2770  transport system permease protein  44.68 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169159  normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  39.44 
 
 		 340 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.84 
 
 		 330 aa  202  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  37.18 
 
 		 362 aa  202  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  39.45 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3279  transport system permease protein  43.48 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.14 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4276  transport system permease protein  49.47 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  38.36 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  40 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  40.74 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  33.53 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  40.5 
 
 		 346 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  35.63 
 
 		 375 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>