More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0443 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  100 
 
 
355 aa  703    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  61.03 
 
 
350 aa  429  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  56.36 
 
 
362 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  51.59 
 
 
360 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  49.13 
 
 
373 aa  359  4e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  48.55 
 
 
374 aa  340  1e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  53.64 
 
 
361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  46.93 
 
 
383 aa  326  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  48.03 
 
 
357 aa  309  5e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  44.19 
 
 
367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  47.26 
 
 
369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  45.61 
 
 
354 aa  296  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  45.69 
 
 
347 aa  297  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  45.87 
 
 
355 aa  297  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  46.02 
 
 
362 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  43.45 
 
 
348 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  42.9 
 
 
348 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  43.54 
 
 
356 aa  289  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  43.96 
 
 
370 aa  290  4e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  43.18 
 
 
348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  49.83 
 
 
301 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  41.6 
 
 
349 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  45.89 
 
 
357 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  43.14 
 
 
340 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  44.71 
 
 
359 aa  272  7e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  41.38 
 
 
344 aa  268  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  42.54 
 
 
356 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  46.94 
 
 
336 aa  263  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  41.39 
 
 
358 aa  263  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  40.8 
 
 
344 aa  262  6e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  42.61 
 
 
357 aa  260  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  45.54 
 
 
363 aa  257  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  39.54 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  39 
 
 
375 aa  253  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  42.66 
 
 
356 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  47.01 
 
 
357 aa  252  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  41.71 
 
 
347 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  43.33 
 
 
350 aa  249  5e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  39.48 
 
 
356 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  40.06 
 
 
356 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  40.52 
 
 
365 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  40.58 
 
 
354 aa  243  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  39.72 
 
 
360 aa  239  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  38.33 
 
 
360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  39.83 
 
 
371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  39.58 
 
 
331 aa  235  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  37.57 
 
 
356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  37.43 
 
 
355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  42.16 
 
 
354 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  40.87 
 
 
361 aa  233  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  43.34 
 
 
356 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  44.29 
 
 
360 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  39.94 
 
 
363 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  46.07 
 
 
360 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  45.71 
 
 
360 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  37.91 
 
 
381 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  41.13 
 
 
360 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  34.66 
 
 
352 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  40.96 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  40.06 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  39.77 
 
 
359 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  39.47 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  39.77 
 
 
359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  39.77 
 
 
359 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  41.55 
 
 
330 aa  220  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  39.16 
 
 
347 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  39.6 
 
 
360 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  39.71 
 
 
359 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  41.36 
 
 
360 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  41.2 
 
 
330 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  39.45 
 
 
334 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  36.42 
 
 
359 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  39.86 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  39.88 
 
 
360 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.39 
 
 
346 aa  212  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  39.88 
 
 
360 aa  212  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  38.29 
 
 
352 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  39.65 
 
 
353 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  38.29 
 
 
352 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  39.62 
 
 
387 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.4 
 
 
337 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  38.68 
 
 
344 aa  210  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  37.54 
 
 
370 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  36.66 
 
 
343 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  34.71 
 
 
345 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  37.14 
 
 
368 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  37.35 
 
 
346 aa  205  9e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  40.07 
 
 
334 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
338 aa  205  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  39.87 
 
 
360 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  39.01 
 
 
347 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  37.03 
 
 
348 aa  203  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  41.07 
 
 
315 aa  204  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  38.36 
 
 
369 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  38.26 
 
 
334 aa  202  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  38.26 
 
 
334 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  38.26 
 
 
334 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  38.6 
 
 
340 aa  202  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.58 
 
 
360 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.9 
 
 
354 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>