More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0685 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  100 
 
 		 334 aa  641    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  100 
 
 		 334 aa  641    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  93.71 
 
 		 363 aa  564  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  95.65 
 
 		 363 aa  553  1e-156  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  47.52 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  45.51 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  43.08 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  43.33 
 
 		 346 aa  268  7e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  43.69 
 
 		 330 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  46.96 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  43.37 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  47.16 
 
 		 315 aa  257  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  52.8 
 
 		 338 aa  255  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  43.79 
 
 		 356 aa  249  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  43.71 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  47.7 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  40.18 
 
 		 350 aa  241  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  42.64 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  44.68 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  38.84 
 
 		 343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  50 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  41.84 
 
 		 367 aa  235  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  48.14 
 
 		 380 aa  233  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  41.11 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  43.17 
 
 		 358 aa  232  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  38.92 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  41.21 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  43.63 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  44.17 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  42.57 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  43.79 
 
 		 350 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  43.61 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  42.99 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  44.69 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  47.74 
 
 		 367 aa  229  4e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  43.84 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  42.12 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  44.22 
 
 		 370 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  47.9 
 
 		 316 aa  228  9e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  40.75 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  43.17 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  44.11 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  43.73 
 
 		 344 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  44.9 
 
 		 371 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  43.97 
 
 		 336 aa  226  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  40.12 
 
 		 355 aa  225  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.01 
 
 		 367 aa  225  9e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  46.6 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  43.1 
 
 		 372 aa  223  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2357  iron compound ABC transporter, permease protein  45.68 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  41.85 
 
 		 348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  44.91 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  41.43 
 
 		 452 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  40 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.61 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  39.75 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  42.4 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  41.23 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  42.91 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  42.91 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6328  transport system permease protein  41.59 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  42.91 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5059  transport system permease protein  46.01 
 
 		 358 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.344774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  41.64 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  40.34 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  42.94 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  38.49 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  42.68 
 
 		 381 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  41.89 
 
 		 383 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  44.72 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  39.32 
 
 		 343 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  36.39 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  36.47 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  39.81 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  39.2 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  38.19 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  43.66 
 
 		 345 aa  212  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  39.88 
 
 		 347 aa  212  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  43.88 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  40.24 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  40 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  41.72 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  42.41 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  36.56 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0657  ABC-type transporter, permease component  41.85 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  38.91 
 
 		 354 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0259  transport system permease protein  38.55 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.950369  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  42.81 
 
 		 346 aa  209  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  45.61 
 
 		 429 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  46.29 
 
 		 340 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  37.2 
 
 		 339 aa  209  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26360  putative permease of ABC transporter  40.13 
 
 		 343 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  44.68 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  38.94 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  42.71 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2792  corrinoid ABC transporter permease  44.95 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.525724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8854  transport system permease protein  42.6 
 
 		 453 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  39.18 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  40.31 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>