More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1316 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  100 
 
 		 338 aa  630  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  46.41 
 
 		 337 aa  301  9e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  43.04 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  42.41 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  47.71 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  53.15 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  52.8 
 
 		 363 aa  256  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  52.8 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  52.8 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  46.79 
 
 		 315 aa  248  8e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  51.79 
 
 		 367 aa  248  8e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  44.09 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  49.64 
 
 		 354 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  49.64 
 
 		 358 aa  245  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  41.9 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  47.16 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  45.86 
 
 		 353 aa  239  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  48.32 
 
 		 345 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  45.24 
 
 		 315 aa  238  9e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  44.04 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  46.06 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  47.93 
 
 		 380 aa  236  6e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  41.54 
 
 		 371 aa  235  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  43.77 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  42.73 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  48.23 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  48.75 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  41.25 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  45.71 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  44.59 
 
 		 357 aa  229  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  46.1 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  46.65 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  43.1 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  50.54 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  41.61 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  43.86 
 
 		 362 aa  226  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  39.88 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  44.13 
 
 		 345 aa  225  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  47.58 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  42.41 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  44.76 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0259  transport system permease protein  41.9 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.950369  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  50.36 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  43.4 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  50.89 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  46.34 
 
 		 452 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  41.8 
 
 		 345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  40.58 
 
 		 345 aa  220  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  47.69 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 		 342 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  44.63 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  46.49 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  38.21 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2792  corrinoid ABC transporter permease  50.35 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.525724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  38.21 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  47.14 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  47.26 
 
 		 429 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  40.12 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  42.86 
 
 		 348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  40.58 
 
 		 342 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 		 342 aa  215  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  45.42 
 
 		 356 aa  215  7e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  40.58 
 
 		 345 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  40.58 
 
 		 345 aa  215  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  43.75 
 
 		 383 aa  215  8e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  37.24 
 
 		 368 aa  215  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  35.01 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  40.71 
 
 		 342 aa  215  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  45.54 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  44.38 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  41.85 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  40.65 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  43.86 
 
 		 372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  49.47 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  42.76 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 		 342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  41.85 
 
 		 345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  47.06 
 
 		 361 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  42.19 
 
 		 343 aa  212  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.36 
 
 		 338 aa  212  7e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  42.56 
 
 		 336 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  46.55 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  45.2 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  44.57 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  42.3 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  51.61 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  42.46 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  41.4 
 
 		 344 aa  210  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  45.26 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  50.35 
 
 		 362 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  39.52 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  44.72 
 
 		 340 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  40.59 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  39.76 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  44.95 
 
 		 358 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  49.65 
 
 		 348 aa  209  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  41.84 
 
 		 350 aa  209  8e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  40.26 
 
 		 344 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  43.45 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>