More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3606 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  100 
 
 
367 aa  699    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  78.31 
 
 
376 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  62.98 
 
 
373 aa  392  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  59.11 
 
 
380 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2792  corrinoid ABC transporter permease  66 
 
 
362 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.525724  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  50.16 
 
 
315 aa  279  7e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  47.74 
 
 
337 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  52.69 
 
 
315 aa  263  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  46.6 
 
 
356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  46.2 
 
 
330 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  44.88 
 
 
330 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  51.79 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  42.45 
 
 
387 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  51.59 
 
 
316 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  43.88 
 
 
336 aa  236  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  42.12 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  48.62 
 
 
358 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  47.75 
 
 
370 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  45.92 
 
 
367 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  48.77 
 
 
354 aa  232  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0259  transport system permease protein  46.4 
 
 
321 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.950369  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  43.56 
 
 
366 aa  229  7e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  47.42 
 
 
371 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  46.37 
 
 
365 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  45.36 
 
 
330 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  47.12 
 
 
452 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  45.07 
 
 
361 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  48.4 
 
 
367 aa  226  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  47.74 
 
 
363 aa  225  8e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  45.92 
 
 
353 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  47.78 
 
 
361 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  47.74 
 
 
363 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  46.64 
 
 
347 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  42.4 
 
 
350 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  46.15 
 
 
334 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  46.15 
 
 
334 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  46.15 
 
 
334 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  48.78 
 
 
345 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  45.88 
 
 
334 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  47.69 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  47.74 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  47.74 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  43.57 
 
 
359 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  40.42 
 
 
331 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  45.14 
 
 
345 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  47.22 
 
 
370 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  45.07 
 
 
340 aa  216  7e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  43.97 
 
 
338 aa  216  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  44.41 
 
 
345 aa  215  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  48.79 
 
 
365 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  40.66 
 
 
338 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  42.4 
 
 
372 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  45.26 
 
 
348 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  48.65 
 
 
354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  44.13 
 
 
351 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  48.56 
 
 
429 aa  212  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  44.03 
 
 
345 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  43.09 
 
 
355 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  42.28 
 
 
330 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  42.28 
 
 
318 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  43.27 
 
 
340 aa  209  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  44.6 
 
 
350 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  45.3 
 
 
343 aa  209  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  45.34 
 
 
351 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  41.33 
 
 
325 aa  207  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1214  transport system permease protein  45.52 
 
 
342 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  44.83 
 
 
356 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  40.2 
 
 
327 aa  207  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  41.24 
 
 
326 aa  207  3e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  41.87 
 
 
326 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.2 
 
 
334 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  48.61 
 
 
361 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  47.2 
 
 
343 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  45.89 
 
 
340 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  39.8 
 
 
336 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  45.82 
 
 
338 aa  204  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  47.74 
 
 
338 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2323  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  47.28 
 
 
365 aa  203  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0471491  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  47.42 
 
 
338 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  43.01 
 
 
362 aa  203  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  45.71 
 
 
338 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  47.08 
 
 
338 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  42.25 
 
 
345 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  47.7 
 
 
341 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  47.04 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  41.07 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  50.35 
 
 
360 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.67 
 
 
390 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1211  transport system permease protein  46.98 
 
 
329 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  40.43 
 
 
347 aa  199  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  44.24 
 
 
351 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  43.12 
 
 
342 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  42.25 
 
 
342 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  44.33 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  39.94 
 
 
368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  44.03 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2441  transport system permease protein  48 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00106696  normal  0.535476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 
342 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>