More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3342 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  100 
 
 		 345 aa  660    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  42.15 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  44.48 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  44.91 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  43.94 
 
 		 358 aa  229  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  40.18 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  43.08 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1214  transport system permease protein  41.14 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  41.69 
 
 		 370 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  40.57 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  42.14 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  42.4 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  43.94 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  44.33 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  40.13 
 
 		 351 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  42.11 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  38.43 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.9 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  41.18 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  40.18 
 
 		 354 aa  209  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  41.8 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  44.8 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  39.34 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  38.02 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1075  putative iron transporter, membrane component  38.55 
 
 		 347 aa  206  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  38.11 
 
 		 380 aa  205  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  40.79 
 
 		 333 aa  206  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  43.19 
 
 		 358 aa  205  8e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  40.93 
 
 		 347 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  44.33 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.05 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  37.24 
 
 		 368 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  42.81 
 
 		 367 aa  202  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  39.51 
 
 		 330 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  40.17 
 
 		 387 aa  202  7e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  43.07 
 
 		 338 aa  202  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  45.83 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  40.6 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  40.7 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  39.04 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  38.85 
 
 		 351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  42.86 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  44.48 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  38.21 
 
 		 346 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  43.03 
 
 		 340 aa  198  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  41.1 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  42.27 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  41.1 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  41.1 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  43.56 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  44.78 
 
 		 376 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  39.76 
 
 		 346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  41.64 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  40.96 
 
 		 361 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.3 
 
 		 390 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  39.93 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  37.69 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  44.44 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  38.23 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1425  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.01036  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  36.47 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  35.91 
 
 		 350 aa  193  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  40.35 
 
 		 360 aa  192  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  35.54 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  43.52 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  41.64 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  38.22 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  42.66 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  43.35 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  43.52 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  42.38 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  37.62 
 
 		 336 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  36.52 
 
 		 362 aa  190  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  38.58 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  36.91 
 
 		 346 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  43.21 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  43.21 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1489  transport system permease protein  40.62 
 
 		 373 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.52 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  39.75 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  38.98 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  39.12 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  42.36 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  39.63 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  39.38 
 
 		 345 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.28 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.28 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  39.87 
 
 		 357 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.93 
 
 		 363 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  39.5 
 
 		 346 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4193  transport system permease protein  40.24 
 
 		 362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0259  transport system permease protein  40 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.950369  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  42.45 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  37.39 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  34.02 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  38.86 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  39.38 
 
 		 342 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 		 342 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  37.88 
 
 		 340 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>