More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0259 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0259  transport system permease protein  100 
 
 		 321 aa  626  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.950369  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  55.35 
 
 		 315 aa  298  6e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  53.42 
 
 		 315 aa  297  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  48.87 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  46.4 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  43.2 
 
 		 355 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  41.9 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  37.2 
 
 		 337 aa  218  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  44.41 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  42.42 
 
 		 380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.24 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  46.44 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  38.48 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2792  corrinoid ABC transporter permease  46.91 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.525724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  37.93 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  41.06 
 
 		 363 aa  209  6e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  42.62 
 
 		 387 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  42.61 
 
 		 348 aa  206  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  42.16 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  42.16 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  42.07 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  40.27 
 
 		 350 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  40.85 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  40.45 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  35.03 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  39 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  34.03 
 
 		 359 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  39.71 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  40.88 
 
 		 340 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  35.55 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  35.11 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  40.14 
 
 		 357 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  38.38 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.2 
 
 		 371 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  41.4 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  39.16 
 
 		 365 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  36.45 
 
 		 361 aa  188  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  36.59 
 
 		 370 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  36.08 
 
 		 322 aa  185  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  37.74 
 
 		 347 aa  185  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  35.13 
 
 		 322 aa  185  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  40.13 
 
 		 345 aa  185  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  35.11 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  35.11 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  39.93 
 
 		 350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 		 366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  35.31 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  35.11 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  35.71 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.48 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  39.24 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  36.94 
 
 		 355 aa  182  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  41.11 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  38.02 
 
 		 322 aa  182  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 		 342 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  36.48 
 
 		 347 aa  182  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  38.91 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  38 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  33.33 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  41.24 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  37.65 
 
 		 354 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  39.21 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  38.71 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  39.55 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  39.22 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  35.14 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  36.25 
 
 		 331 aa  180  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  37 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  38.05 
 
 		 369 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  36.56 
 
 		 356 aa  179  7e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  38.73 
 
 		 345 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  35.54 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  35.37 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  36.7 
 
 		 337 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  37.35 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  35.2 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  38.75 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  36.53 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  37.97 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  36.59 
 
 		 370 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  36.83 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  40.29 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  38.89 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  40.07 
 
 		 367 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  41.87 
 
 		 357 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  36.15 
 
 		 344 aa  175  7e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 		 352 aa  175  7e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  35.52 
 
 		 350 aa  175  8e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  37.94 
 
 		 368 aa  175  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  40.72 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  36.17 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  38.97 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  38.97 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  36.94 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1969  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>