More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0650 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  100 
 
 
327 aa  637    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  68.81 
 
 
326 aa  448  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  62.31 
 
 
331 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1787  hemin ABC transporter, permease protein, putative  60.19 
 
 
328 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1969  putative hemin ABC transporter, permease protein  57.62 
 
 
328 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1602  hemin ABC transporter, permease protein, putative  59.55 
 
 
328 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  42.05 
 
 
315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  38.66 
 
 
330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  39.43 
 
 
380 aa  210  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.34 
 
 
330 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.23 
 
 
346 aa  206  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  35.28 
 
 
367 aa  199  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  36.36 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.09 
 
 
337 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  39.86 
 
 
360 aa  196  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  35.85 
 
 
345 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  40.2 
 
 
367 aa  192  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 
343 aa  192  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  39.65 
 
 
362 aa  192  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  35.01 
 
 
336 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  36.36 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  39.24 
 
 
330 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  37.32 
 
 
372 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  34.91 
 
 
371 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  38.8 
 
 
348 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  34.6 
 
 
354 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  36.84 
 
 
358 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  37.54 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  34.88 
 
 
338 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  39.58 
 
 
315 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  35.78 
 
 
337 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  38.24 
 
 
387 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  33.93 
 
 
383 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  36.77 
 
 
361 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.81 
 
 
350 aa  182  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  32.22 
 
 
345 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  34.29 
 
 
334 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  34.29 
 
 
334 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  35.8 
 
 
338 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  31.91 
 
 
342 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  34.29 
 
 
334 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  34.95 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  37.02 
 
 
363 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  35.74 
 
 
344 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  36.84 
 
 
354 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  36.75 
 
 
347 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.15 
 
 
325 aa  178  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.03 
 
 
334 aa  178  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.03 
 
 
334 aa  178  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 
342 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 
342 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  32.51 
 
 
356 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  34.65 
 
 
348 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  34.66 
 
 
355 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  36.68 
 
 
363 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  36.93 
 
 
312 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 
342 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  36.51 
 
 
345 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  35.18 
 
 
373 aa  176  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  33.23 
 
 
338 aa  176  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  32.33 
 
 
345 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  32.33 
 
 
345 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  32.33 
 
 
342 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 
342 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  34.71 
 
 
340 aa  176  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  35.02 
 
 
348 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  36.3 
 
 
330 aa  175  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  38.46 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  34.26 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  35.42 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  36.3 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  33.53 
 
 
368 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  34.23 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  31.76 
 
 
355 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  35.29 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  34.73 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  35.54 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  36.3 
 
 
338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  37.85 
 
 
345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  37.41 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  35.45 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  35.67 
 
 
351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  32.91 
 
 
370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  34.63 
 
 
368 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  35.45 
 
 
338 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  33.24 
 
 
368 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  37.88 
 
 
376 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  35.15 
 
 
338 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  32.75 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  35.15 
 
 
338 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  37.41 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  36.52 
 
 
350 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  34.83 
 
 
367 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  33.12 
 
 
359 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  33.97 
 
 
340 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  35.74 
 
 
353 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  35.52 
 
 
334 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  36.66 
 
 
361 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  35.81 
 
 
381 aa  170  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  34.42 
 
 
357 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>