More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2874 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  100 
 
 		 360 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  64.35 
 
 		 390 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  55.42 
 
 		 452 aa  347  3e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2760  transport system permease protein  63.66 
 
 		 361 aa  316  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.325591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  51.56 
 
 		 367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0372  transport system permease protein  57.05 
 
 		 429 aa  296  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  47.72 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3878  transport system permease protein  64.16 
 
 		 386 aa  285  9e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0478721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  47.78 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  46.86 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  46.88 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  45.74 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  49.65 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  46.75 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  46.6 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  43.65 
 
 		 370 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  42.99 
 
 		 347 aa  233  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  49.64 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  44.34 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  44.17 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  46.73 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  41.99 
 
 		 345 aa  229  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  44 
 
 		 343 aa  229  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  35.56 
 
 		 368 aa  229  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  43 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  43 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  43 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  43.77 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  40.77 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  35.48 
 
 		 350 aa  226  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  41.57 
 
 		 345 aa  225  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  44.91 
 
 		 343 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  43.65 
 
 		 370 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  40.36 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0181  transport system permease protein  45.22 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816049  normal  0.0731846 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2323  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  42.48 
 
 		 365 aa  222  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0471491  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  41.52 
 
 		 368 aa  222  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  44.61 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  37.24 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  44.61 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  43.95 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  46.55 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  43.95 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  39.58 
 
 		 330 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  46.58 
 
 		 326 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  40.97 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  44.03 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  43.41 
 
 		 338 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  37.84 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  47.33 
 
 		 358 aa  212  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  48.19 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4799  transport system permease protein  45.88 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000697014  hitchhiker  0.00165127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  48 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.68 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  48.4 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2135  transport system permease protein  43.43 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370402  normal  0.644336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  43.29 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  34.15 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  35.96 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  41.44 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.52 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  40.82 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0572  hemin transport system permease protein hmuU  46.58 
 
 		 360 aa  207  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0899796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  40 
 
 		 345 aa  206  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  41.1 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.72 
 
 		 363 aa  206  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4193  transport system permease protein  48.76 
 
 		 362 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  40 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  42.18 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.21 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.21 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.63 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  38.79 
 
 		 344 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  41.5 
 
 		 336 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  45.13 
 
 		 373 aa  202  7e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0344  transport system permease protein  46.13 
 
 		 362 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  41.25 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1211  transport system permease protein  45.86 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  38.31 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0746  transport system permease protein  50 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0337726  hitchhiker  0.0000000000140721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5428  transport system permease protein  44.35 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5434  transport system permease protein  44.35 
 
 		 362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.197656  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  42.09 
 
 		 344 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1755  heme transporter protein HuvC, transmembrane permease component  40.56 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00487431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  38.16 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  37.19 
 
 		 362 aa  198  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  41.34 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  38.82 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  36.59 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  35.21 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  41.99 
 
 		 345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5377  hemin ABC-transport system permease  39.12 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0079296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  34.36 
 
 		 346 aa  196  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2441  transport system permease protein  41.64 
 
 		 342 aa  195  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00106696  normal  0.535476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  41.75 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  38.23 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2349  transport system permease protein  45.31 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.055128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3619  transport system permease protein  44.11 
 
 		 379 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  38.67 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>