More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1473 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 338 aa  659    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  52.01 
 
 		 344 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  53.09 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  50.3 
 
 		 369 aa  309  5e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  51.04 
 
 		 339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  49.53 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  45.81 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  50.16 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  50.57 
 
 		 354 aa  279  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  47.28 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  47.31 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  43.81 
 
 		 368 aa  272  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  51.12 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  45.56 
 
 		 336 aa  269  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.15 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  46.82 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  48.6 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  50.31 
 
 		 350 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  49.56 
 
 		 349 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  44.38 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  50.93 
 
 		 349 aa  262  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.22 
 
 		 362 aa  262  6e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  50.16 
 
 		 337 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  50.96 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  48.73 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  46.01 
 
 		 327 aa  258  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  46.01 
 
 		 327 aa  258  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  44.55 
 
 		 350 aa  258  8e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  49.68 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  45.14 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  44.73 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  43.71 
 
 		 335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  41.72 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  42.99 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  44.87 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  50 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  43.71 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  48.58 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  44.96 
 
 		 345 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  45.51 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  45.66 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  43.89 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  41.05 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  49.03 
 
 		 353 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  49.52 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  43.82 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  45.1 
 
 		 338 aa  231  9e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  42.06 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  41.9 
 
 		 348 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  45.35 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  43.32 
 
 		 359 aa  228  8e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  46.15 
 
 		 332 aa  228  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  46.67 
 
 		 340 aa  228  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  38.32 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  44.87 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  44.98 
 
 		 331 aa  225  8e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  42.48 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  43.81 
 
 		 336 aa  223  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  43.35 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  45.13 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  41.21 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  43.16 
 
 		 340 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  38.11 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  44.68 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  39.71 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  46.56 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  38.7 
 
 		 348 aa  215  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  41.09 
 
 		 367 aa  215  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  42.81 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  42.99 
 
 		 354 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  47.52 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  48.11 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  48.55 
 
 		 322 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  43.53 
 
 		 339 aa  209  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  45.93 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  42.68 
 
 		 342 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.48 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  41.92 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  43.04 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  43.04 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  39.01 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  42.73 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  39.72 
 
 		 330 aa  198  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  42.15 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  40.07 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  37.76 
 
 		 370 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  38.62 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  45.82 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  38.29 
 
 		 347 aa  192  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.12 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  38.28 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  37.5 
 
 		 355 aa  189  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  39.4 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  39.4 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  39.4 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  36.39 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  40.36 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  45.63 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.63 
 
 		 346 aa  186  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 		 366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>