More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1533 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
335 aa  655    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  75.24 
 
 
341 aa  449  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  51.88 
 
 
346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  50.46 
 
 
362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  49.25 
 
 
350 aa  325  6e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  44.58 
 
 
331 aa  275  8e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  45.2 
 
 
369 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  45.54 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 
343 aa  268  8e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  44.69 
 
 
344 aa  268  8e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  42.77 
 
 
336 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  45.31 
 
 
354 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  43.08 
 
 
344 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.71 
 
 
338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  44.69 
 
 
336 aa  248  9e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  47.78 
 
 
354 aa  247  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  47.12 
 
 
349 aa  246  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  42.2 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  44.03 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  44.41 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  44.03 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  40.85 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  37.76 
 
 
359 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.74 
 
 
358 aa  241  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  42.07 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  40.99 
 
 
324 aa  238  8e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  45.66 
 
 
349 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  43.37 
 
 
340 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  43.45 
 
 
334 aa  231  9e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  44.37 
 
 
340 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  42.04 
 
 
337 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  42.81 
 
 
349 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
356 aa  226  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  41.72 
 
 
339 aa  225  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  44.62 
 
 
350 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  47.3 
 
 
337 aa  222  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  39.02 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  39.02 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  47.45 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  43.83 
 
 
353 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  36.31 
 
 
363 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  43.82 
 
 
338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  37.13 
 
 
338 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  45.25 
 
 
326 aa  216  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  39.87 
 
 
348 aa  216  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.49 
 
 
351 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  36.48 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  40.38 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  42.01 
 
 
340 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  41.88 
 
 
322 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  37.22 
 
 
347 aa  210  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  42.41 
 
 
324 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  43.62 
 
 
341 aa  209  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  37.88 
 
 
368 aa  209  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  42.86 
 
 
331 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  41.9 
 
 
356 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  41.56 
 
 
332 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  38.94 
 
 
349 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  37.2 
 
 
348 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  39.72 
 
 
336 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  46.18 
 
 
332 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
359 aa  202  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  38.26 
 
 
341 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  40.45 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  42.66 
 
 
339 aa  200  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  36.01 
 
 
339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  36.57 
 
 
335 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  41.42 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  35.59 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  37.23 
 
 
340 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  40.85 
 
 
333 aa  193  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  35.71 
 
 
367 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  39.46 
 
 
326 aa  189  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.51 
 
 
337 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  33.23 
 
 
330 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  33.84 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  40 
 
 
358 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  36.51 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  44.09 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  36.53 
 
 
346 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  37.89 
 
 
452 aa  178  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  36.65 
 
 
318 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  42.62 
 
 
350 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  36.3 
 
 
330 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  33.74 
 
 
350 aa  175  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  33.24 
 
 
368 aa  175  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  33.97 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  35.84 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  36.3 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  36.83 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  33.33 
 
 
330 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  34.29 
 
 
367 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  36.92 
 
 
341 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  33.86 
 
 
360 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  38.63 
 
 
327 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.97 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  33.81 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  32.45 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  33.53 
 
 
361 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  35.19 
 
 
371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>