More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5521 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  100 
 
 		 341 aa  621  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  76.79 
 
 		 349 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  77.01 
 
 		 349 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  78.85 
 
 		 349 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  79.42 
 
 		 353 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  55.24 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  56.33 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  58.41 
 
 		 350 aa  321  9.000000000000001e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  62.99 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  51.86 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  47.79 
 
 		 369 aa  308  8e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  54.69 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  57.28 
 
 		 331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  49.52 
 
 		 336 aa  302  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  59.44 
 
 		 326 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  48.1 
 
 		 343 aa  297  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  47.81 
 
 		 331 aa  295  7e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  53.35 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  47.68 
 
 		 372 aa  293  4e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  48.94 
 
 		 332 aa  286  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  59.29 
 
 		 322 aa  285  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  46.5 
 
 		 346 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  55.28 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  59.55 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  49.54 
 
 		 339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  57.1 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  49.06 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.25 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  47.77 
 
 		 337 aa  269  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  46.86 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.71 
 
 		 358 aa  259  6e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  41.74 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  40.99 
 
 		 340 aa  251  9.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  42.41 
 
 		 335 aa  248  8e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  56.15 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  41.46 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  44.89 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  44.13 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  51.86 
 
 		 358 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  43.41 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  43.67 
 
 		 368 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  44.76 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  42.55 
 
 		 348 aa  238  9e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  44.31 
 
 		 348 aa  238  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.22 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  39.58 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  39.49 
 
 		 341 aa  232  7.000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  45.51 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  42.81 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  40.76 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  41.16 
 
 		 347 aa  229  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  46.08 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  46.33 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  40.85 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  43.12 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  43.12 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  42.01 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  43.09 
 
 		 326 aa  222  6e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  42.17 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  39.41 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  37.78 
 
 		 347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  45.06 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  42.94 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  38.44 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  40.12 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  45.37 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  42.98 
 
 		 356 aa  205  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  44.94 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  39.22 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  39.03 
 
 		 361 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  39.22 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  39.27 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  41.06 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  43.53 
 
 		 339 aa  199  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  45.67 
 
 		 342 aa  199  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  41.46 
 
 		 333 aa  198  9e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  44.85 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  45.28 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  41.88 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  40.8 
 
 		 326 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  38.97 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  42.71 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.75 
 
 		 367 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  45.79 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  44.59 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  37.83 
 
 		 355 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  39.22 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  43.21 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  42.07 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  37.8 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  44.11 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  41.87 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  37.02 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  44.25 
 
 		 363 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  42.5 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  41.3 
 
 		 363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  42.68 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  41.5 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>