More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2735 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  100 
 
 		 353 aa  643    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  78.1 
 
 		 349 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  81.37 
 
 		 349 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  82.96 
 
 		 349 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  79.42 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  54.92 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  55.84 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  56.11 
 
 		 350 aa  319  6e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  55.31 
 
 		 340 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  61.89 
 
 		 331 aa  308  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  47.9 
 
 		 369 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  61.36 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  50.62 
 
 		 344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  50.8 
 
 		 354 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  46.47 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  48.01 
 
 		 336 aa  299  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  48.21 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  50.14 
 
 		 372 aa  293  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  55.92 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  48.25 
 
 		 346 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  48.33 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  54.42 
 
 		 354 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  58.2 
 
 		 322 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  54.29 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  47.66 
 
 		 336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  59.24 
 
 		 350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  47.37 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  55.16 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  47.02 
 
 		 338 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  47.28 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.02 
 
 		 362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  42.29 
 
 		 350 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.06 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  46.82 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  52.91 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  43.69 
 
 		 335 aa  256  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  43.63 
 
 		 336 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  42.05 
 
 		 368 aa  249  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  54.43 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  40.59 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  43.59 
 
 		 341 aa  245  6.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.65 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  41.9 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  46.03 
 
 		 334 aa  241  9e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  42.27 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  38.92 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  48.72 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  43.81 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  42.72 
 
 		 333 aa  233  5e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  42.86 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  42.86 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  43.67 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  47.89 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  40.63 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  43.57 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  39.82 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  42.15 
 
 		 363 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  41.53 
 
 		 347 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  41.1 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  46.26 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  38.15 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  43.3 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  41.67 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  46.08 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  47.04 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  46.69 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  41.72 
 
 		 338 aa  212  9e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  46.18 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  44.14 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  43.6 
 
 		 349 aa  210  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  44.06 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  44.01 
 
 		 339 aa  206  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  42.82 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.16 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.41 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  42.81 
 
 		 354 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  39.05 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  40.6 
 
 		 346 aa  202  7e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 		 359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  41.64 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  43.09 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.83 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  41.82 
 
 		 380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.24 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  40.77 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  43.07 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  43.17 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  41.54 
 
 		 366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  39.57 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  43.44 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  46.4 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  45.71 
 
 		 354 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  42.06 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  39.38 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  42.11 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  44.95 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  45.34 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  47.7 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  37.31 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  39.4 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>