More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2222 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  100 
 
 		 346 aa  676    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  52.98 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  51.55 
 
 		 362 aa  351  8.999999999999999e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  51.61 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  51.88 
 
 		 335 aa  329  6e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  54.31 
 
 		 341 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  50.16 
 
 		 344 aa  324  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  49.53 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  46.43 
 
 		 354 aa  290  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  47.21 
 
 		 354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  49.85 
 
 		 339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  47.28 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  43.75 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  46.76 
 
 		 349 aa  276  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  47.23 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  47.91 
 
 		 349 aa  268  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  44.48 
 
 		 336 aa  268  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  45.29 
 
 		 349 aa  268  8.999999999999999e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  48.23 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  48.36 
 
 		 349 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  44.14 
 
 		 344 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  44.16 
 
 		 331 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  48.08 
 
 		 350 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  46.18 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  48.53 
 
 		 353 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  44.44 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.57 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  41.95 
 
 		 338 aa  246  6e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  43.21 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  43.69 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  42.24 
 
 		 356 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.46 
 
 		 351 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  40.12 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  41.61 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  40.51 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  39.16 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  41.8 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  40.95 
 
 		 326 aa  232  8.000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  40.31 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  46.56 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  40.55 
 
 		 348 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  38.71 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  38.39 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  43.37 
 
 		 332 aa  225  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  46.21 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  42.99 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  39.05 
 
 		 324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.34 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  34.94 
 
 		 347 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  37.54 
 
 		 363 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  39.56 
 
 		 339 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  46.35 
 
 		 337 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  40 
 
 		 345 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  39.94 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  40.13 
 
 		 349 aa  216  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  39.1 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  39.1 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  46.98 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  40 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  43.77 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  40.85 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  40.26 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  45.98 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  40.13 
 
 		 342 aa  209  7e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  37.62 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  38.99 
 
 		 359 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  42.54 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  38.28 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  38.96 
 
 		 333 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  39.37 
 
 		 356 aa  199  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  37.11 
 
 		 347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  45.95 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  37.58 
 
 		 335 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  43.75 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  38.34 
 
 		 354 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  36.86 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.45 
 
 		 367 aa  189  5.999999999999999e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  34.4 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  36.53 
 
 		 346 aa  187  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  33.23 
 
 		 337 aa  185  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  32.92 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  34.49 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  34.46 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  35.37 
 
 		 348 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 		 366 aa  182  7e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  42.42 
 
 		 327 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  31.85 
 
 		 330 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  42.42 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  36.02 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  37.16 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  39.94 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  36.34 
 
 		 346 aa  180  4e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  35.31 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 343 aa  179  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  38.8 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  38.8 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  38.8 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  31.61 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  35.24 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  33.97 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>