More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2080 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  100 
 
 		 368 aa  723    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  58.39 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  46.91 
 
 		 340 aa  299  6e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  46.36 
 
 		 343 aa  275  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 		 338 aa  272  7e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  47.32 
 
 		 336 aa  270  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  45.02 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  38.48 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  47.45 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  46.57 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  43.12 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  41.85 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  44.77 
 
 		 354 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  43.71 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  42.81 
 
 		 369 aa  250  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  43.5 
 
 		 332 aa  248  9e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  41.38 
 
 		 363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  44.09 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  44.28 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  40.76 
 
 		 347 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  44.28 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  44.74 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.68 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  41.28 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  44.35 
 
 		 345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  42.99 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  36.81 
 
 		 362 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  45.14 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  43.31 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  45.77 
 
 		 350 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  45.34 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  46.67 
 
 		 341 aa  228  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  43 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  45.13 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  43.59 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  42.63 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  43.4 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  44.41 
 
 		 348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  43.67 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  40.45 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  43.17 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  44.9 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  45.16 
 
 		 353 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  41.25 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.04 
 
 		 367 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  40.45 
 
 		 350 aa  219  5e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  43.48 
 
 		 349 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  39.94 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  42.02 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  40.55 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  44.41 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  47.75 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  41.61 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.3 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  42.11 
 
 		 363 aa  210  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  37.88 
 
 		 335 aa  209  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.87 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  38.36 
 
 		 329 aa  209  9e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  43.27 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  44.68 
 
 		 363 aa  206  5e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  41.03 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  41.39 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  41.29 
 
 		 341 aa  206  6e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  41.12 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  41.12 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  44.48 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  38.44 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  43.22 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  38.44 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  40.53 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  43.44 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  37.87 
 
 		 330 aa  203  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  41.96 
 
 		 326 aa  203  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  43.4 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  42.94 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  41.8 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  45.34 
 
 		 332 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  43.82 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  38.79 
 
 		 348 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.29 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.29 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  40.7 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  40.07 
 
 		 348 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  37.15 
 
 		 333 aa  199  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  42.86 
 
 		 326 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  42.16 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  37.42 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  40.91 
 
 		 348 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  37.14 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  37.11 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.09 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  42.21 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  42.73 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  45.65 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  42.47 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  37.54 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  39.41 
 
 		 345 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  39.18 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  39.66 
 
 		 352 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>