More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1695 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  100 
 
 		 349 aa  686    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  90.26 
 
 		 349 aa  569  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  70.26 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  58.75 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  57.06 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  54.91 
 
 		 369 aa  358  6e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  54.2 
 
 		 372 aa  352  5.9999999999999994e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  55.45 
 
 		 341 aa  341  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  55.95 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  52.8 
 
 		 349 aa  325  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  53.7 
 
 		 349 aa  325  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  52.8 
 
 		 349 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  53.5 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  55.23 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  52.76 
 
 		 331 aa  316  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  54.32 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  57.09 
 
 		 354 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  54.98 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  51.85 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  46.76 
 
 		 346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  57.46 
 
 		 332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  47.45 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  50.46 
 
 		 338 aa  300  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  54.97 
 
 		 358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.73 
 
 		 351 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  51.92 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  55.52 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  47.2 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  51.1 
 
 		 340 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  41.79 
 
 		 344 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  49.1 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  46.65 
 
 		 347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  48.56 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  51.66 
 
 		 337 aa  268  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  46.63 
 
 		 335 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  52.24 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  43.77 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  45.16 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  46.5 
 
 		 341 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.44 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  42.99 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  50.16 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  46.62 
 
 		 341 aa  263  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  51.31 
 
 		 326 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  46.96 
 
 		 339 aa  262  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  49.68 
 
 		 322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  52.55 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  42.68 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  41.55 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  47.3 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  41.82 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  41.82 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  43.6 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  39.26 
 
 		 347 aa  245  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  41.72 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  45.51 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  37.36 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  44.65 
 
 		 324 aa  237  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  41.93 
 
 		 349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  40.68 
 
 		 338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  44.98 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  46.33 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  43.35 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  42.14 
 
 		 337 aa  232  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  42.29 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  39.44 
 
 		 367 aa  228  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  40.12 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  42.55 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  39.26 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  40.3 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  39.56 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  39.5 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  43.73 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  40.3 
 
 		 346 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  42.14 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  43.75 
 
 		 342 aa  218  7.999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  42.54 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  39.25 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  42.55 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  42.59 
 
 		 339 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  39.13 
 
 		 350 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  38.96 
 
 		 336 aa  212  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  42.12 
 
 		 354 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  44.68 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  44.37 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  45.11 
 
 		 341 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  41.36 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  36.29 
 
 		 361 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  39.49 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  44.86 
 
 		 383 aa  195  9e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  38.84 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  39.74 
 
 		 380 aa  192  7e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  42.09 
 
 		 315 aa  192  9e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  37.61 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  38.64 
 
 		 452 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 		 366 aa  189  5.999999999999999e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  39.56 
 
 		 367 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  38.1 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  39.04 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  39.04 
 
 		 330 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>