More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0028 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  100 
 
 		 354 aa  685    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  61.45 
 
 		 344 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  53.6 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  63.54 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  52.6 
 
 		 339 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  50.87 
 
 		 343 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  57.09 
 
 		 349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  52.33 
 
 		 350 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  47.66 
 
 		 350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  50.57 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  47.21 
 
 		 346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  57.09 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  46.41 
 
 		 372 aa  295  7e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  55.28 
 
 		 341 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.57 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  47.16 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  48.85 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  48.85 
 
 		 349 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  48.65 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  51.96 
 
 		 332 aa  276  4e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  46.18 
 
 		 331 aa  276  5e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  48.75 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  49.65 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  54.42 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  51.57 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  47.78 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  46.22 
 
 		 337 aa  262  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  51.81 
 
 		 340 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.37 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  43.77 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  48.97 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  47.54 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  43.03 
 
 		 348 aa  259  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  45.1 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  50.87 
 
 		 358 aa  257  3e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  48.64 
 
 		 336 aa  257  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  44.74 
 
 		 368 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  39.44 
 
 		 340 aa  256  5e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  48.08 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  42.68 
 
 		 356 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  53.92 
 
 		 332 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  48.75 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  46.41 
 
 		 327 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  46.41 
 
 		 327 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  44.07 
 
 		 347 aa  249  7e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  45.05 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  44.31 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  43.45 
 
 		 336 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  44.37 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  51.09 
 
 		 340 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  53.2 
 
 		 358 aa  242  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  55.05 
 
 		 334 aa  242  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  46.76 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  53.41 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  42.34 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  45.3 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  51.8 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  40.92 
 
 		 363 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  50.35 
 
 		 322 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  52.6 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  42.32 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  42.73 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  47.16 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  43.45 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  46.23 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  40.74 
 
 		 346 aa  227  3e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  46.08 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  49.45 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  44.03 
 
 		 367 aa  225  9e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  47.69 
 
 		 338 aa  225  9e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  46.1 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  45.94 
 
 		 339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  42.05 
 
 		 346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  46.78 
 
 		 354 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  44.32 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  45.2 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  45.2 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  44.1 
 
 		 355 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  45.02 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  39.79 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  40.41 
 
 		 337 aa  205  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  49.65 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  40.94 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  39.79 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  45.42 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  43.06 
 
 		 315 aa  199  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  41.5 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  41.18 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  44.77 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  44.33 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  39.26 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  40.93 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  39.12 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  39.46 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  38.85 
 
 		 370 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  37.58 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.02 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  38.78 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  35.51 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.84 
 
 		 373 aa  186  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>