More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1287 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  100 
 
 
336 aa  654    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  68.36 
 
 
336 aa  448  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  46.65 
 
 
331 aa  289  6e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  45.87 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  45.92 
 
 
372 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  43.4 
 
 
336 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  46.42 
 
 
332 aa  276  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  49.39 
 
 
350 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  44.88 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  45.43 
 
 
343 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  44.86 
 
 
335 aa  265  7e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  46.97 
 
 
339 aa  265  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  48.42 
 
 
349 aa  264  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  47.5 
 
 
349 aa  262  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  43.29 
 
 
344 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  47.15 
 
 
337 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  44.41 
 
 
349 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  44.41 
 
 
349 aa  255  7e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  40.06 
 
 
347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  46.08 
 
 
340 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  44.76 
 
 
349 aa  252  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  44.29 
 
 
354 aa  248  9e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  43.95 
 
 
354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  43.17 
 
 
348 aa  246  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  40.84 
 
 
347 aa  245  6e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  41.74 
 
 
350 aa  242  7e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  40.45 
 
 
346 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.66 
 
 
362 aa  242  7.999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.36 
 
 
338 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  41.46 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  43.31 
 
 
341 aa  239  5e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  44.44 
 
 
324 aa  239  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.02 
 
 
358 aa  236  4e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  46.13 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  39.24 
 
 
356 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  40.55 
 
 
340 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.56 
 
 
351 aa  230  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  44.76 
 
 
322 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  40.55 
 
 
327 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  40.55 
 
 
327 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  39.76 
 
 
340 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  40.13 
 
 
341 aa  226  6e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  39.34 
 
 
338 aa  225  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  43.63 
 
 
353 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  39.05 
 
 
359 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  38.46 
 
 
324 aa  222  9e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  39.75 
 
 
341 aa  220  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  41.28 
 
 
345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  42.68 
 
 
339 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
326 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  39.32 
 
 
333 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  40.42 
 
 
340 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  46.84 
 
 
332 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  43.22 
 
 
334 aa  217  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  39.39 
 
 
348 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  38.29 
 
 
368 aa  216  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  44.27 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  40.52 
 
 
367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  37.07 
 
 
363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  38.78 
 
 
335 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  38.64 
 
 
337 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  43.58 
 
 
358 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  41.3 
 
 
337 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  44.34 
 
 
337 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  40.75 
 
 
326 aa  209  7e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  41.8 
 
 
332 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  39.66 
 
 
336 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  41.34 
 
 
333 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  47.32 
 
 
334 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  40.24 
 
 
356 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.72 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.51 
 
 
355 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  46.06 
 
 
350 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  35.85 
 
 
339 aa  193  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  38.14 
 
 
349 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  36.71 
 
 
339 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  38.2 
 
 
337 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  40.42 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  38.58 
 
 
342 aa  189  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  40.13 
 
 
346 aa  187  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  34.86 
 
 
368 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  41.12 
 
 
354 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.49 
 
 
346 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  40.9 
 
 
363 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  35.99 
 
 
330 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  38.14 
 
 
318 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  40 
 
 
359 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.49 
 
 
330 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  36.62 
 
 
333 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  36.87 
 
 
452 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  36.72 
 
 
354 aa  185  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  35.19 
 
 
356 aa  185  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  38.46 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  40.13 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.12 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  37.88 
 
 
330 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  37.63 
 
 
361 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  35.29 
 
 
362 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  38.83 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  36.7 
 
 
358 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>