More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2393 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 359 aa  709    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  68.52 
 
 		 359 aa  501  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  59.71 
 
 		 356 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  42.17 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.27 
 
 		 343 aa  269  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  44.28 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.32 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  42.31 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  39.76 
 
 		 344 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  42.59 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  43.97 
 
 		 344 aa  249  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  42.24 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  45.07 
 
 		 332 aa  242  7.999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  43.17 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  41.08 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  38.99 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  40.18 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  42.2 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  40 
 
 		 350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  39.17 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  41.69 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  40 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  43.47 
 
 		 362 aa  232  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  42.12 
 
 		 346 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  46.1 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  38.46 
 
 		 335 aa  230  4e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  38.7 
 
 		 338 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  40.42 
 
 		 336 aa  227  3e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  40.3 
 
 		 349 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  40.72 
 
 		 349 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  41.82 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  44.04 
 
 		 315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  38.81 
 
 		 355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  38.74 
 
 		 452 aa  222  7e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  38.97 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  41.96 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  37.89 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  36.64 
 
 		 362 aa  220  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  41.16 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  45.19 
 
 		 327 aa  219  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  45.19 
 
 		 327 aa  219  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  39.55 
 
 		 341 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  40.84 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  37.2 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  38.91 
 
 		 345 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  40.59 
 
 		 338 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  39.75 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  34.53 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  38.7 
 
 		 370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  42.36 
 
 		 332 aa  215  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  36.83 
 
 		 348 aa  215  9e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  38.69 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  43.71 
 
 		 363 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.74 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.3 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  42.86 
 
 		 357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  36.26 
 
 		 348 aa  212  9e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  39.08 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  43.73 
 
 		 350 aa  212  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  36.73 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  37.82 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  40.99 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  35.59 
 
 		 348 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  36.83 
 
 		 348 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  39 
 
 		 357 aa  209  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  45.68 
 
 		 349 aa  209  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  43.01 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  43.01 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  42.24 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  39.29 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  40 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  36.29 
 
 		 354 aa  205  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  39.36 
 
 		 354 aa  205  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  39.53 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  44.77 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  40.2 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  42.75 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  39.66 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  39.24 
 
 		 333 aa  204  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  35.26 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  39.68 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  39.15 
 
 		 356 aa  202  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  37.83 
 
 		 335 aa  202  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  39.93 
 
 		 330 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  39.5 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  35.69 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  38.32 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  33.33 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  39.55 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  37.2 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  36.96 
 
 		 361 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  38.19 
 
 		 387 aa  199  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  38.22 
 
 		 344 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  35.12 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  37.92 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  36.86 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  40.71 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  34.56 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>