More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0154 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  100 
 
 
351 aa  673    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  69.35 
 
 
339 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  57.14 
 
 
341 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  54.78 
 
 
341 aa  342  5.999999999999999e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  52.44 
 
 
356 aa  305  7e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  50.89 
 
 
327 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  50.89 
 
 
327 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  49.85 
 
 
348 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  52.19 
 
 
337 aa  292  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  50.89 
 
 
333 aa  291  8e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  49.69 
 
 
333 aa  291  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  51.37 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  46.69 
 
 
343 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  48.73 
 
 
349 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  47.32 
 
 
338 aa  270  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  48.58 
 
 
349 aa  266  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  42.2 
 
 
369 aa  255  8e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  42.94 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  45.12 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  50.47 
 
 
332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  45.22 
 
 
332 aa  253  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  46.48 
 
 
327 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  47.55 
 
 
336 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  44.41 
 
 
339 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  44.31 
 
 
350 aa  248  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  46.42 
 
 
350 aa  247  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  45.79 
 
 
341 aa  246  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  43.14 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  46.39 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  45.37 
 
 
354 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  40.56 
 
 
372 aa  242  7.999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  42.38 
 
 
346 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  48.65 
 
 
342 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  46.46 
 
 
326 aa  238  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  45.74 
 
 
354 aa  236  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  44.03 
 
 
341 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  44.72 
 
 
349 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  45.03 
 
 
349 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  39.69 
 
 
359 aa  225  8e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  46.91 
 
 
334 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  43.75 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  41.32 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  39.57 
 
 
335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  39.82 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  42.9 
 
 
337 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  39.75 
 
 
340 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  38.48 
 
 
344 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.94 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.5 
 
 
358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  42.36 
 
 
348 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  40.12 
 
 
336 aa  212  9e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  44.59 
 
 
353 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  39.18 
 
 
347 aa  211  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  43.17 
 
 
368 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  41.56 
 
 
341 aa  210  3e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  40.12 
 
 
340 aa  209  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  42.77 
 
 
334 aa  208  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  43.13 
 
 
331 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  43.86 
 
 
326 aa  205  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  37.77 
 
 
347 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  43.82 
 
 
358 aa  199  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  45.4 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  38.61 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  37.39 
 
 
359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  41.64 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  39.94 
 
 
326 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  40.55 
 
 
340 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  41.28 
 
 
383 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  41.08 
 
 
332 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  46.07 
 
 
337 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  42.01 
 
 
339 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  36.36 
 
 
324 aa  185  9e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.06 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  39.56 
 
 
345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  35.37 
 
 
330 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  40.13 
 
 
339 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.45 
 
 
337 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  35.31 
 
 
346 aa  177  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  44.63 
 
 
362 aa  176  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  40.19 
 
 
340 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  38.27 
 
 
324 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.89 
 
 
315 aa  175  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.37 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  35.77 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  41.32 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  37.94 
 
 
347 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.86 
 
 
363 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  36.97 
 
 
363 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  36.95 
 
 
362 aa  169  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  35.31 
 
 
346 aa  169  7e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.51 
 
 
334 aa  169  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  39.51 
 
 
334 aa  169  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  35.61 
 
 
363 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5018  ABC transporter membrane spanning protein (iron (III))  37.16 
 
 
327 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  38.03 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  39.62 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  39.56 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  37.99 
 
 
333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  34.01 
 
 
348 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.14 
 
 
334 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>