More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0602 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  100 
 
 		 333 aa  642    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  57.88 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  49.21 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  49.21 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  49.84 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  49.69 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  47.4 
 
 		 348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  49.55 
 
 		 356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  50.64 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  47.29 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  49.36 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  42.99 
 
 		 341 aa  266  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  50 
 
 		 338 aa  261  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.12 
 
 		 343 aa  259  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  45.03 
 
 		 336 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  43.28 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  46.91 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  42.38 
 
 		 369 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 		 338 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  40.06 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  43.85 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  42.14 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 		 339 aa  228  8e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  44.27 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  42.64 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  40.38 
 
 		 341 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  48.75 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  41.72 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  45.74 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  42.25 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.43 
 
 		 362 aa  220  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  40.82 
 
 		 340 aa  219  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  40.49 
 
 		 335 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  42.41 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  42.36 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  41.37 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  40.26 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  44.09 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  46.26 
 
 		 326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  40.99 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  43.31 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  42.27 
 
 		 348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  42.2 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  36.73 
 
 		 344 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  41.93 
 
 		 349 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  41.61 
 
 		 349 aa  209  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  38.77 
 
 		 347 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  38.92 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  48.46 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  41.28 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  40.71 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.29 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  38.34 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  42.63 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  39.44 
 
 		 356 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  37.91 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  38.87 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  37.54 
 
 		 340 aa  192  8e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  41.01 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  40.13 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.57 
 
 		 367 aa  186  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  41.22 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  34.45 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  37.86 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  36.27 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  43.01 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  41.7 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  38.14 
 
 		 359 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.66 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  42.81 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  35.39 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  38.73 
 
 		 363 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  42.4 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  36.59 
 
 		 363 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  39 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  40 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.03 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.03 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  38.38 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  39.93 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  33.03 
 
 		 345 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  37.54 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  40 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  40.27 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  34.27 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.77 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  40.84 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  37.34 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  34.88 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  37.63 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  37.83 
 
 		 383 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  38.32 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  36.9 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  33.89 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  32.13 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  36.04 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1577  transport system permease protein  36.46 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  33.9 
 
 		 350 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  32.84 
 
 		 355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  37.67 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>