More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1577 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1577  transport system permease protein  100 
 
 		 322 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  81.99 
 
 		 322 aa  485  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  75.33 
 
 		 323 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1461  transport system permease protein  77.29 
 
 		 323 aa  418  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1922  transport system permease protein  78.19 
 
 		 353 aa  391  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  70.37 
 
 		 312 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  57.23 
 
 		 354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3756  transport system permease protein  63.85 
 
 		 343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4031  transport system permease protein  58.41 
 
 		 325 aa  302  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2788  transport system permease protein  54.37 
 
 		 335 aa  268  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.890347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0655  transport system permease protein  55.52 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355285  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2460  transport system permease protein  56.54 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2666  transport system permease protein  55.66 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.616984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0996  transport system permease protein  56.53 
 
 		 350 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2212  transport system permease protein  56.13 
 
 		 349 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1844  transport system permease protein  57.05 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2455  transport system permease protein  57.05 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2208  transport system permease protein  55.14 
 
 		 339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.2353 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2503  transport system permease protein  57.05 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2614  transport system permease protein  52.22 
 
 		 329 aa  236  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2371  transport system permease protein  56.86 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1189  putative transmembrane ABC transporter permease  56.54 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.501145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1036  cobalamin ABC transporter, permease protein  56.54 
 
 		 342 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2326  cobalamin ABC transporter, permease protein  56.54 
 
 		 342 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3259  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0839  transport system permease protein  56.96 
 
 		 450 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1029  cobalamin ABC transporter, permease protein  56.54 
 
 		 333 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0818949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2960  cobalamin ABC transporter, permease protein  56.54 
 
 		 333 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0686  iron compound ABC transporter, permease protein  56.54 
 
 		 333 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1638  cobalamin ABC transporter, permease protein  56.54 
 
 		 333 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2399  transmembrane ABC transporter protein  55.35 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0835  iron compound ABC transporter, permease protein  56.03 
 
 		 342 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5786  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  56.39 
 
 		 332 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3501  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, inner membrane subunit  55.49 
 
 		 336 aa  225  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.89 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  41.5 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  37.54 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  41.64 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  36.28 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  39.31 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  43.27 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  42.5 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.39 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  41.31 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  42.71 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  39.58 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  39.93 
 
 		 361 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  41.72 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  40.95 
 
 		 351 aa  188  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  43.5 
 
 		 338 aa  188  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  40 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  39.35 
 
 		 350 aa  188  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  40.9 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  36.1 
 
 		 356 aa  186  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  39.3 
 
 		 369 aa  185  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  37.46 
 
 		 355 aa  183  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  38.79 
 
 		 359 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.45 
 
 		 355 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  43.35 
 
 		 352 aa  182  9.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  41.84 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  38.06 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  36.77 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  37.85 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  38.44 
 
 		 338 aa  178  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1070  transport system permease protein  41.16 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  43.01 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  38.05 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  34.8 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  39.68 
 
 		 319 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  38.17 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  38.87 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  40.62 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  35.78 
 
 		 351 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 		 351 aa  175  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 		 351 aa  175  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  38.05 
 
 		 363 aa  175  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  38.33 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  37.82 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  42.28 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  34.29 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1268  transport system permease protein  40.79 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  39.56 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  39.56 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  39.6 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  39.56 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  41.55 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  39.12 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  37.81 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  36.28 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  35.37 
 
 		 351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  35.35 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  35.37 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  35.37 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  40.92 
 
 		 380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  37.68 
 
 		 369 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  36.62 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1969  putative hemin ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  40 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  36.92 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>