More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2614 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2614  transport system permease protein  100 
 
 
329 aa  616  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  54.73 
 
 
323 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  51.42 
 
 
322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4031  transport system permease protein  54.35 
 
 
325 aa  269  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3756  transport system permease protein  56.45 
 
 
343 aa  268  8.999999999999999e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  51.14 
 
 
312 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1577  transport system permease protein  52.49 
 
 
322 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1461  transport system permease protein  52.96 
 
 
323 aa  262  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  49.53 
 
 
354 aa  259  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2788  transport system permease protein  48.32 
 
 
335 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.890347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1922  transport system permease protein  52.36 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2460  transport system permease protein  53.52 
 
 
371 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0655  transport system permease protein  46.73 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355285  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1844  transport system permease protein  54.23 
 
 
371 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2455  transport system permease protein  54.23 
 
 
371 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  42.25 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2666  transport system permease protein  47.66 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.616984  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  42.04 
 
 
363 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2399  transmembrane ABC transporter protein  48.11 
 
 
335 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2371  transport system permease protein  54.23 
 
 
339 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2208  transport system permease protein  48.08 
 
 
339 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2353 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2503  transport system permease protein  54.23 
 
 
332 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0835  iron compound ABC transporter, permease protein  50.49 
 
 
342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0839  transport system permease protein  54.48 
 
 
450 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1189  putative transmembrane ABC transporter permease  51.31 
 
 
333 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.501145  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2212  transport system permease protein  48.7 
 
 
349 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907416  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0996  transport system permease protein  47.5 
 
 
350 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0686  iron compound ABC transporter, permease protein  50.98 
 
 
333 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1036  cobalamin ABC transporter, permease protein  50.98 
 
 
342 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2960  cobalamin ABC transporter, permease protein  50.98 
 
 
333 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.259511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1638  cobalamin ABC transporter, permease protein  50.98 
 
 
333 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1029  cobalamin ABC transporter, permease protein  50.98 
 
 
333 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0818949  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2326  cobalamin ABC transporter, permease protein  50.98 
 
 
342 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5786  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  53.17 
 
 
332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  41.4 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  41.4 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  36.34 
 
 
348 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  37.72 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  36.83 
 
 
369 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  35.47 
 
 
329 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  42.14 
 
 
381 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  34.02 
 
 
346 aa  176  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  35.77 
 
 
348 aa  175  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3501  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, inner membrane subunit  46.88 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  35.77 
 
 
348 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  40.48 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  36.39 
 
 
350 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  42.66 
 
 
357 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  35.44 
 
 
336 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  41.97 
 
 
358 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  36.2 
 
 
334 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.75 
 
 
337 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  36.17 
 
 
350 aa  169  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  36.88 
 
 
346 aa  169  9e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.12 
 
 
330 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  40.68 
 
 
334 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  40.68 
 
 
334 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  40.68 
 
 
334 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  35.67 
 
 
330 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  33.53 
 
 
362 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  42.14 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  36.48 
 
 
318 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.45 
 
 
330 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  37.28 
 
 
332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  36.25 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  40.07 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  38.24 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  39.1 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  38.73 
 
 
347 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  41.2 
 
 
354 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  39 
 
 
315 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  34.85 
 
 
331 aa  162  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  41.26 
 
 
351 aa  162  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  34.69 
 
 
343 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  38.63 
 
 
354 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  37.1 
 
 
338 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  38.6 
 
 
315 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 
356 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1268  transport system permease protein  38.23 
 
 
345 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  37.06 
 
 
337 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  35.06 
 
 
344 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  38.06 
 
 
361 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  33.33 
 
 
359 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  36.91 
 
 
357 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  39.08 
 
 
345 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  38.63 
 
 
353 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  36.57 
 
 
356 aa  159  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  33.44 
 
 
323 aa  159  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  35.21 
 
 
336 aa  159  9e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  40.34 
 
 
350 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  41.26 
 
 
335 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  36.25 
 
 
339 aa  158  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  40.12 
 
 
344 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  36.45 
 
 
322 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1969  putative hemin ABC transporter, permease protein  37.89 
 
 
328 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1602  hemin ABC transporter, permease protein, putative  37.89 
 
 
328 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  39.33 
 
 
350 aa  158  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  36.14 
 
 
336 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 
339 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  35.65 
 
 
349 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>