More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0498 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  100 
 
 
349 aa  693    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  74.43 
 
 
348 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  74.43 
 
 
348 aa  544  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  75 
 
 
348 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  50.43 
 
 
354 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  52.71 
 
 
357 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  53.22 
 
 
344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  52.05 
 
 
344 aa  348  7e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  48.43 
 
 
357 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  48.84 
 
 
340 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  49.15 
 
 
356 aa  338  9e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  48.71 
 
 
358 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  53.92 
 
 
370 aa  332  8e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  51.51 
 
 
359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  47.43 
 
 
355 aa  325  1e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  44.99 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  53.62 
 
 
357 aa  300  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  46.38 
 
 
363 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  47.3 
 
 
336 aa  299  5e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  44.22 
 
 
357 aa  298  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  49.57 
 
 
356 aa  297  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  45.45 
 
 
350 aa  294  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  46.75 
 
 
359 aa  289  6e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.25 
 
 
346 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  47.4 
 
 
356 aa  279  6e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  41.36 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  38.76 
 
 
362 aa  269  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  41.71 
 
 
360 aa  261  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  41.26 
 
 
350 aa  256  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  42.11 
 
 
367 aa  249  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  41.55 
 
 
369 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.82 
 
 
373 aa  236  6e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  40.73 
 
 
361 aa  235  9e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  40.23 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  39 
 
 
375 aa  231  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  41.87 
 
 
374 aa  228  9e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  41.31 
 
 
346 aa  226  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  45.73 
 
 
301 aa  223  4e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  38.55 
 
 
347 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  44.98 
 
 
362 aa  216  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  39.46 
 
 
361 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  39.51 
 
 
363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  39.05 
 
 
356 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  35.24 
 
 
356 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  41.42 
 
 
378 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  37.37 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  35.92 
 
 
355 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  35.4 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.39 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  37.42 
 
 
368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  36.29 
 
 
356 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.61 
 
 
337 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  39.38 
 
 
372 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  35.71 
 
 
356 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  40.89 
 
 
368 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  37.43 
 
 
323 aa  192  8e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 
325 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  37.84 
 
 
352 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  36.88 
 
 
315 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  39.41 
 
 
351 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.62 
 
 
355 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  35.6 
 
 
381 aa  190  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  33.72 
 
 
357 aa  189  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  35.23 
 
 
354 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1284  transport system permease protein  39.69 
 
 
338 aa  189  7e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.601831 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  35.03 
 
 
331 aa  189  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  37.57 
 
 
332 aa  188  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  39.52 
 
 
315 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  33.81 
 
 
365 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  33.92 
 
 
345 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  35.24 
 
 
360 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  40.41 
 
 
318 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  37.27 
 
 
347 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 
342 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 
342 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.66 
 
 
347 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  40.07 
 
 
330 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  35.17 
 
 
359 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  32.66 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  37.59 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.57 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  38.75 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  37.59 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  37.59 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.52 
 
 
363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  41.02 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1787  hemin ABC transporter, permease protein, putative  34.41 
 
 
328 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  33.63 
 
 
345 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  33.63 
 
 
345 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1602  hemin ABC transporter, permease protein, putative  34.41 
 
 
328 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1969  putative hemin ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 
342 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  33.63 
 
 
342 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  37.09 
 
 
338 aa  182  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  35.44 
 
 
354 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  37.54 
 
 
358 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.18 
 
 
363 aa  182  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.97 
 
 
334 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  36.69 
 
 
360 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>