More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1268 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1268  transport system permease protein  100 
 
 		 345 aa  662    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0754  FecCD transport family protein  81.1 
 
 		 345 aa  510  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.671626  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1070  transport system permease protein  75.07 
 
 		 342 aa  498  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1121  transport system permease protein  74.64 
 
 		 343 aa  474  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1136  FecCD transport family protein  80.27 
 
 		 322 aa  457  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500551  normal  0.214464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  71.77 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1513  transport system permease protein  71.12 
 
 		 341 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  44.44 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  41.92 
 
 		 337 aa  209  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.09 
 
 		 330 aa  202  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.09 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  36.23 
 
 		 337 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  44.26 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  40.47 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  40.36 
 
 		 338 aa  192  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  43.96 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 		 366 aa  189  5.999999999999999e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  38.69 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  39.41 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  37.89 
 
 		 340 aa  186  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  37.97 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  36.24 
 
 		 362 aa  186  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  40.36 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  40.89 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  38.14 
 
 		 370 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  39.03 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  39.58 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  35.82 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  38.44 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.72 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  38.04 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  37.67 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  38.73 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.59 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  38.14 
 
 		 452 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.73 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  40.14 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  35.76 
 
 		 367 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.36 
 
 		 334 aa  175  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  38.36 
 
 		 334 aa  175  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  36.31 
 
 		 361 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  36.65 
 
 		 387 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  36.97 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  40.07 
 
 		 322 aa  172  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  39.65 
 
 		 354 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  34.77 
 
 		 336 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  37.93 
 
 		 322 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  36.81 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  38.91 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  37.93 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  38.57 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  33.45 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  38.49 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  37.63 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  34.94 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  44.64 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  38.89 
 
 		 348 aa  169  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  39 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  37.85 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  36.3 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  41.58 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  35.46 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  36.88 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  41.06 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  37.62 
 
 		 342 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  35.89 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  37.67 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  37.41 
 
 		 380 aa  165  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  34.64 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  36.96 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  35.05 
 
 		 372 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  38.1 
 
 		 373 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  38.28 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  37.76 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  39.5 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  37.17 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  36.93 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  36.75 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  36.49 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  32.21 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  37.46 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  37.46 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  37.46 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  38.25 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  38.04 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  36.93 
 
 		 342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  39.57 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  36.93 
 
 		 345 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  36.93 
 
 		 345 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  34.45 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  38.19 
 
 		 341 aa  163  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  36.93 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  36.93 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  36.24 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  37.94 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2167  transport system permease protein  38.36 
 
 		 341 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0116294  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  37.67 
 
 		 355 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4031  transport system permease protein  38.73 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3203  putative transmembrane ABC transporter protein,permease  38.81 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>