More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1473 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  100 
 
 		 359 aa  711    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  68.52 
 
 		 359 aa  462  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  61.18 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  52.36 
 
 		 343 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  47.31 
 
 		 338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  41.62 
 
 		 340 aa  271  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  45.02 
 
 		 368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  46.21 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  43.24 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  46.74 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  44.06 
 
 		 383 aa  259  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  45.05 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  42.25 
 
 		 369 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  42.64 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  38.92 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  42.6 
 
 		 346 aa  249  7e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  40.12 
 
 		 350 aa  248  9e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  41.07 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  41.69 
 
 		 336 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  42.77 
 
 		 367 aa  244  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  37.76 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  39.88 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  43.2 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  40.06 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  43.81 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  40.64 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  40.12 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  47.54 
 
 		 354 aa  236  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  42.77 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  40.28 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.79 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  39 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  39.31 
 
 		 361 aa  233  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  41.08 
 
 		 331 aa  233  5e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  41.97 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  47.45 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  42.59 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  42.99 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  39.94 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  39 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  40.97 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  39.37 
 
 		 348 aa  225  9e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  39.4 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  39.3 
 
 		 347 aa  224  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  39.25 
 
 		 330 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.06 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  39.7 
 
 		 339 aa  222  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  38.94 
 
 		 330 aa  222  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  41.3 
 
 		 341 aa  222  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  43.12 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  43.12 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  37.85 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  42.4 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  39.12 
 
 		 345 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  43.14 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  39.19 
 
 		 327 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  39.19 
 
 		 327 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  43.96 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.94 
 
 		 358 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  39.08 
 
 		 340 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  35.35 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  40.36 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  40.99 
 
 		 333 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  40.18 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  38.59 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  40.07 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  35.14 
 
 		 347 aa  212  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  40 
 
 		 341 aa  212  7.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  39.42 
 
 		 336 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  34.65 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.57 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  41.16 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  41.43 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  38.79 
 
 		 452 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  44.09 
 
 		 350 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  39.56 
 
 		 354 aa  209  7e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.28 
 
 		 354 aa  209  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  38.19 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  40.86 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  44.84 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  41.08 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  38.1 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  39.88 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  39.16 
 
 		 337 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  43.12 
 
 		 373 aa  204  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  39.86 
 
 		 380 aa  202  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  39.81 
 
 		 345 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  38.79 
 
 		 330 aa  202  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  37.5 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  36.42 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.26 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  32.61 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  40.87 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  42.65 
 
 		 367 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  34.53 
 
 		 347 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  37 
 
 		 357 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  38.97 
 
 		 348 aa  198  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  35.67 
 
 		 370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  39.22 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>