More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1121 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  100 
 
 
372 aa  729    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  61.74 
 
 
337 aa  368  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  51.6 
 
 
369 aa  330  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  48.6 
 
 
344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  56.41 
 
 
349 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  51.28 
 
 
343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  55.08 
 
 
350 aa  315  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  56.09 
 
 
349 aa  315  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  48.87 
 
 
354 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  50.31 
 
 
339 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  49.53 
 
 
338 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  50.14 
 
 
349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  48.06 
 
 
341 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  50.96 
 
 
349 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.5 
 
 
362 aa  278  9e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  48.3 
 
 
332 aa  278  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  50.95 
 
 
349 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  43.75 
 
 
346 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  46.41 
 
 
354 aa  275  9e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  46.87 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  45.97 
 
 
331 aa  268  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  47.72 
 
 
340 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  41.34 
 
 
350 aa  267  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  51.76 
 
 
332 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  42.26 
 
 
347 aa  266  5.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  46.01 
 
 
336 aa  265  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  45.08 
 
 
336 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  51.3 
 
 
340 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  41.85 
 
 
368 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  46.18 
 
 
340 aa  256  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  51.12 
 
 
353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  44.87 
 
 
334 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  41.88 
 
 
344 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  51.75 
 
 
334 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.77 
 
 
358 aa  249  4e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  41.07 
 
 
359 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  49.64 
 
 
326 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  43.11 
 
 
348 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  53.76 
 
 
322 aa  245  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  40.85 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  41.53 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  42.04 
 
 
338 aa  240  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.95 
 
 
351 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  37.78 
 
 
356 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  43.08 
 
 
333 aa  237  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  41.35 
 
 
340 aa  238  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  49.11 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  48.01 
 
 
358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  43.36 
 
 
326 aa  230  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.4 
 
 
367 aa  229  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  40.57 
 
 
327 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  40.57 
 
 
327 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  41.67 
 
 
341 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  41.8 
 
 
339 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  48.21 
 
 
337 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  36.68 
 
 
347 aa  222  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  38.06 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  44.16 
 
 
332 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  45.57 
 
 
324 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  39.3 
 
 
348 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  40.46 
 
 
345 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  43.62 
 
 
356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  39.93 
 
 
341 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  42.55 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  40.32 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.52 
 
 
330 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  43.17 
 
 
333 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  39.51 
 
 
330 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  38.39 
 
 
337 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  42.24 
 
 
383 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  40.55 
 
 
342 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.66 
 
 
355 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  40.41 
 
 
339 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  35.89 
 
 
361 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  44.44 
 
 
354 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  41.72 
 
 
339 aa  206  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  36.59 
 
 
324 aa  206  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  41.96 
 
 
315 aa  203  5e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  39.17 
 
 
346 aa  203  5e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  40.82 
 
 
349 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 
359 aa  202  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  39.94 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  37.71 
 
 
375 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  43.77 
 
 
363 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  43.73 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  37.5 
 
 
336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  42.4 
 
 
367 aa  199  7.999999999999999e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  42.68 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  43.1 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  43.1 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  36.12 
 
 
350 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  43.22 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  41.88 
 
 
315 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  38.78 
 
 
452 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  39.35 
 
 
380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  40.48 
 
 
352 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  38.98 
 
 
370 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  37.06 
 
 
355 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  39.38 
 
 
349 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  47.9 
 
 
350 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>