More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01860 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  100 
 
 		 358 aa  709    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  49.71 
 
 		 343 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  44.32 
 
 		 369 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  51.91 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  47.77 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  46.73 
 
 		 344 aa  296  3e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  46.55 
 
 		 331 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.35 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  45.65 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  45.59 
 
 		 350 aa  290  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  48.4 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  50.47 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  47.95 
 
 		 339 aa  286  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  43.85 
 
 		 372 aa  286  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  47.04 
 
 		 346 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  48.82 
 
 		 350 aa  278  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  47.76 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  47.92 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  48.87 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  45.4 
 
 		 338 aa  276  6e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  44.83 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  46.87 
 
 		 349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  45.62 
 
 		 336 aa  272  8.000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  48.23 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  50.87 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  46.25 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  44.1 
 
 		 368 aa  265  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  42.86 
 
 		 344 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  48.24 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  44.87 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  41.44 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  45.85 
 
 		 340 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  51.13 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  48.06 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  39.88 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  39.94 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  45.85 
 
 		 358 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  45.91 
 
 		 338 aa  248  2e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  50.18 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.5 
 
 		 351 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  45.67 
 
 		 339 aa  243  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  43.95 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  39.62 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  39.7 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  51.45 
 
 		 334 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  46.77 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  44.29 
 
 		 333 aa  235  8e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  39.94 
 
 		 338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  39.28 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  47.41 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  38.26 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  41.32 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  41.22 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  41.22 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  38.17 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  43.41 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  44.13 
 
 		 341 aa  228  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  44.91 
 
 		 340 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  38.78 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  40.87 
 
 		 345 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  47.48 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  40 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  44.81 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  40.69 
 
 		 324 aa  222  9e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  41.62 
 
 		 356 aa  222  9e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  42.94 
 
 		 346 aa  219  6e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  40.77 
 
 		 339 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  42.56 
 
 		 326 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  47.14 
 
 		 333 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  41.87 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.89 
 
 		 367 aa  215  8e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  41.09 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  43.57 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  43.3 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  40.54 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  42.26 
 
 		 332 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  43.12 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  42.31 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  38.97 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  37.91 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  43.88 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  43.88 
 
 		 327 aa  199  7e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  33.03 
 
 		 330 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  35.33 
 
 		 367 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  36.81 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  37.97 
 
 		 347 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  33.52 
 
 		 361 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  30.86 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  37.69 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  44.19 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  41.16 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  36.39 
 
 		 452 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  33.52 
 
 		 366 aa  185  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  32.29 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  39.08 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  34.58 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.61 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.61 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  34.1 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  37.69 
 
 		 348 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>