More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1703 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  100 
 
 
352 aa  684    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0744  transport system permease protein  64.01 
 
 
345 aa  426  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.290337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1620  transport system permease protein  58.57 
 
 
350 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  47.98 
 
 
347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  45.3 
 
 
357 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  43.99 
 
 
360 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  44.28 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7623  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  44.12 
 
 
354 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  42.52 
 
 
365 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  45.08 
 
 
356 aa  272  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  43.71 
 
 
356 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  45.57 
 
 
347 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  45.29 
 
 
360 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  44.37 
 
 
331 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  43.43 
 
 
356 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  41.19 
 
 
371 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  41.18 
 
 
360 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  43.27 
 
 
359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  42.69 
 
 
359 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  42.69 
 
 
359 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  42.4 
 
 
359 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  42.69 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  47.13 
 
 
360 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  43.35 
 
 
354 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  41.28 
 
 
352 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1239  transport system permease protein  47.45 
 
 
360 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  41.41 
 
 
360 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7104  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  43.81 
 
 
360 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  44.87 
 
 
360 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2719  transport system permease protein  43.1 
 
 
352 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000728456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2634  iron chelate ABC transporter permease protein  42.82 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000212766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.13 
 
 
367 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  43.53 
 
 
353 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  43.53 
 
 
360 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  43.53 
 
 
360 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  45.91 
 
 
360 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2568  transport system permease protein  41.57 
 
 
344 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538415  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  38.94 
 
 
319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0798  transport system permease protein  40.18 
 
 
343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.180919  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  38.6 
 
 
362 aa  209  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  38.83 
 
 
350 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  34.39 
 
 
360 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4770  transport system permease protein  42.57 
 
 
353 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  34.66 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  34.46 
 
 
373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  33.99 
 
 
383 aa  196  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  35.47 
 
 
358 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  30.14 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  31.84 
 
 
361 aa  189  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  32.09 
 
 
357 aa  189  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  34.8 
 
 
374 aa  189  9e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  31.03 
 
 
355 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  36.91 
 
 
361 aa  186  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  34.73 
 
 
362 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  31.64 
 
 
354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  34.04 
 
 
346 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  31.16 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  30.22 
 
 
359 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  33.86 
 
 
363 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  34.48 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  28.29 
 
 
348 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  30.09 
 
 
370 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0534  transport system permease protein  33.94 
 
 
334 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  32.59 
 
 
347 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  31.9 
 
 
340 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  28.16 
 
 
348 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  30.43 
 
 
344 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
343 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  36.08 
 
 
301 aa  176  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  31.79 
 
 
375 aa  176  6e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  30.58 
 
 
357 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  31.69 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  31.58 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  27.17 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  29.86 
 
 
344 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  32.35 
 
 
336 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  37.62 
 
 
351 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 
338 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  35.35 
 
 
315 aa  169  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  31.87 
 
 
381 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  36.77 
 
 
347 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  34.75 
 
 
348 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  30.33 
 
 
356 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  31.58 
 
 
337 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  28.53 
 
 
356 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  30.57 
 
 
356 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  32.65 
 
 
341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  35.11 
 
 
352 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  33.44 
 
 
360 aa  165  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  32.68 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  31.58 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  34.5 
 
 
334 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2163  transport system permease protein  31.79 
 
 
336 aa  162  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  34.13 
 
 
347 aa  162  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0875  transport system permease protein  33.24 
 
 
368 aa  162  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  36.33 
 
 
378 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  32.46 
 
 
330 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  35.69 
 
 
354 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>