More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3222 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  100 
 
 		 358 aa  662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  55.9 
 
 		 349 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  59.69 
 
 		 332 aa  302  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  54.32 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  50.3 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  54.97 
 
 		 350 aa  289  6e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  60.31 
 
 		 334 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  49.38 
 
 		 343 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  48.01 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  46.56 
 
 		 369 aa  280  3e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  53.42 
 
 		 341 aa  276  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  46.37 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  53.2 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  52.83 
 
 		 349 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  51.99 
 
 		 349 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  51.41 
 
 		 339 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  50.43 
 
 		 349 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  44.78 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  46.39 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  45.07 
 
 		 332 aa  256  5e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.79 
 
 		 362 aa  256  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  45.28 
 
 		 336 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  48.58 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  42.35 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  53.61 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  46.71 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  43.77 
 
 		 346 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  43.04 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  56.32 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.65 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  43.12 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  41.23 
 
 		 344 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  52.77 
 
 		 337 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  43.94 
 
 		 336 aa  235  7e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  46.18 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  44.38 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  50.48 
 
 		 331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  45.82 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  43.1 
 
 		 368 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  45.87 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  52.05 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  38.21 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  43.7 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  48.23 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  42.94 
 
 		 341 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  37.89 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  40.55 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  47.86 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  43.88 
 
 		 335 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  45.36 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  42.4 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  42.04 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  43.16 
 
 		 338 aa  216  7e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  45.29 
 
 		 342 aa  216  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  46.95 
 
 		 337 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  40.48 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  40.79 
 
 		 359 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  41.53 
 
 		 363 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  51.43 
 
 		 356 aa  212  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  41.18 
 
 		 326 aa  212  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  42.72 
 
 		 341 aa  210  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  42.31 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  42.31 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  52 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  46.58 
 
 		 333 aa  205  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  44.51 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  39.53 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  39.29 
 
 		 346 aa  199  5e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  40.31 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  38.91 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  44.68 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  34.39 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  45.77 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  45.77 
 
 		 341 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.52 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  44.18 
 
 		 358 aa  192  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  42.45 
 
 		 335 aa  192  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  39.94 
 
 		 338 aa  192  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  41.8 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  43.46 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  39.58 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  35.76 
 
 		 361 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  40.88 
 
 		 345 aa  186  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  41.94 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  40.99 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  45.14 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.8 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  39.02 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.6 
 
 		 346 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  38.82 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  42.12 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  38.5 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  35.42 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  40.47 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  34.9 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  36.93 
 
 		 375 aa  176  5e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  35.07 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.84 
 
 		 371 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  41.5 
 
 		 370 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  37.54 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>