More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1116 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  96.5 
 
 
343 aa  654    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  100 
 
 
343 aa  671    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  49.39 
 
 
339 aa  302  5.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  46.06 
 
 
350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  43.95 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  37.79 
 
 
337 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.89 
 
 
346 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  41.11 
 
 
354 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  39.43 
 
 
363 aa  215  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  40 
 
 
358 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  39.12 
 
 
363 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0534  transport system permease protein  37.77 
 
 
334 aa  208  9e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  35.45 
 
 
367 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  36.55 
 
 
347 aa  206  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  35.29 
 
 
355 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  35.86 
 
 
362 aa  202  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.43 
 
 
334 aa  202  8e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.43 
 
 
334 aa  202  8e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  38.75 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.63 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  37.92 
 
 
359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  36.59 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  36.11 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  38.21 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  34.34 
 
 
361 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  36.33 
 
 
330 aa  196  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  36.62 
 
 
356 aa  196  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  35.21 
 
 
452 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  40.13 
 
 
348 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
366 aa  192  5e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  34.58 
 
 
350 aa  192  6e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  34 
 
 
353 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  36.91 
 
 
345 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  36.18 
 
 
354 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  37.28 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  37.28 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  37.28 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  34.29 
 
 
345 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  35.37 
 
 
338 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  37.41 
 
 
369 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  36.71 
 
 
318 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  33.64 
 
 
347 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  37.24 
 
 
338 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  36.36 
 
 
330 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  37.32 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  37.29 
 
 
371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  36.45 
 
 
340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  33.44 
 
 
333 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  35.85 
 
 
370 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  33.94 
 
 
350 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  33.64 
 
 
353 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  38.25 
 
 
315 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  33.03 
 
 
340 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  38.04 
 
 
332 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  34.31 
 
 
368 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  36.24 
 
 
357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  37.94 
 
 
351 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  34.77 
 
 
353 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  37.37 
 
 
357 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  34.76 
 
 
366 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  32.73 
 
 
336 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  33.82 
 
 
343 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2311  transport system permease protein  34.97 
 
 
351 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  37.58 
 
 
348 aa  179  7e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  35.29 
 
 
334 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  36.89 
 
 
343 aa  179  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  31.98 
 
 
355 aa  179  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  34.8 
 
 
340 aa  179  9e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  37.81 
 
 
337 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  36.84 
 
 
357 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  37.46 
 
 
344 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  33.66 
 
 
337 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0761  iron-compound ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
347 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  34.59 
 
 
338 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  33.24 
 
 
350 aa  177  3e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  34.8 
 
 
340 aa  177  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  31.65 
 
 
360 aa  176  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  35.76 
 
 
341 aa  176  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  33.33 
 
 
337 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  37.34 
 
 
348 aa  176  6e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  34.55 
 
 
326 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  32.33 
 
 
336 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  36.18 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  36.64 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  33.79 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  31.91 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  35.14 
 
 
336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  36.06 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  31.21 
 
 
372 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  33.12 
 
 
346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  32.84 
 
 
356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4080  transport system permease protein  34.46 
 
 
362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.812252  normal  0.031541 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  34.28 
 
 
357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  35.49 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  35.2 
 
 
338 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  35.19 
 
 
338 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  31.9 
 
 
374 aa  173  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  32.92 
 
 
368 aa  173  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  38.28 
 
 
358 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>