More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3703 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  100 
 
 		 341 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  57.41 
 
 		 351 aa  352  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  58.92 
 
 		 339 aa  352  4e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  46.24 
 
 		 343 aa  289  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  43.63 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  44.64 
 
 		 327 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  44.64 
 
 		 327 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  42.99 
 
 		 333 aa  272  6e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  47.34 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  42.99 
 
 		 348 aa  262  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  46.13 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  41.79 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  41.14 
 
 		 369 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  46.52 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  47.01 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  45.99 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  43.24 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  43.11 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  42.86 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  41.44 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.6 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  45.89 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  41.49 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  44.51 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  42.34 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  43.42 
 
 		 339 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  39.76 
 
 		 344 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  42.6 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  41.85 
 
 		 354 aa  229  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  38.99 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  39.88 
 
 		 326 aa  222  7e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  41 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  41.82 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  45.79 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  41.57 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  42.4 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  41.56 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  38.46 
 
 		 348 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  39.75 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  41.01 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1213  transport system permease protein  41.03 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0536991  hitchhiker  0.0000000935619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  45.23 
 
 		 342 aa  215  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  38.2 
 
 		 346 aa  215  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  42.12 
 
 		 349 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  43.77 
 
 		 353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  36.86 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1495  ABC transporter, permease protein, FecCD family  40.72 
 
 		 341 aa  210  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  37.85 
 
 		 335 aa  209  7e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  40.69 
 
 		 340 aa  208  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.77 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  40.69 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  41.27 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  39.58 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  35.69 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  36.01 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.09 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  42.68 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  40.74 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  40.18 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  38.11 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  39.04 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47150  transport system permease protein  44.27 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  42.9 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  36.47 
 
 		 324 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  37.62 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 		 359 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  38.87 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  39.62 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  39.09 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  35.44 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  43.49 
 
 		 350 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  35.88 
 
 		 363 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  40 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  39.1 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  36.64 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  32.45 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  33.52 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  33.53 
 
 		 355 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  40.78 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  41.03 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  37.72 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  31.29 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0039  transport system permease protein  34.99 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00235157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  31.29 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  38.95 
 
 		 383 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  33.53 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  34.36 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1602  hemin ABC transporter, permease protein, putative  32.73 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  33.92 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1787  hemin ABC transporter, permease protein, putative  32.42 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1969  putative hemin ABC transporter, permease protein  32.42 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  34.8 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  31.75 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  33.53 
 
 		 327 aa  157  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  36.81 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  36.81 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  35.64 
 
 		 346 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  34.63 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>