More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0561 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  100 
 
 		 346 aa  680    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  46.75 
 
 		 348 aa  275  6e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  41.96 
 
 		 337 aa  268  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  44.15 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  44.19 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  43.03 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  43.12 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  40.29 
 
 		 353 aa  245  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  37.46 
 
 		 350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.86 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  44.86 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  40.06 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  44.09 
 
 		 338 aa  222  6e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  41.05 
 
 		 345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  36.42 
 
 		 329 aa  219  7.999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  37.46 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  36.89 
 
 		 343 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  38.01 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  42.12 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  38.76 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  39.57 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  42.07 
 
 		 350 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  40.47 
 
 		 337 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  34.55 
 
 		 361 aa  212  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  39.93 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0417  transport system permease protein  40.57 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  36.8 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  38.1 
 
 		 367 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  39.46 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  41.79 
 
 		 315 aa  209  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2233  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  36.9 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0722413  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  41.61 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0039  transport system permease protein  39.33 
 
 		 323 aa  207  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00831442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  36.98 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  39.62 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  32.95 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  36.23 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  41.44 
 
 		 362 aa  206  5e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  36.26 
 
 		 354 aa  205  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  38.81 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.07 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  39.2 
 
 		 358 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0754  FecCD transport family protein  42.12 
 
 		 345 aa  202  7e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.671626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  40.64 
 
 		 357 aa  202  8e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  37.81 
 
 		 367 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  44.6 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  35.12 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1075  putative iron transporter, membrane component  36.84 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  43.23 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 356 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  38.95 
 
 		 365 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.93 
 
 		 315 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  37.46 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  36.66 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 		 387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3381  transport system permease protein  37.54 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  34.31 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  38.37 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  36.15 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  36.75 
 
 		 351 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  39.22 
 
 		 362 aa  196  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  39.51 
 
 		 356 aa  196  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  37.24 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  35.59 
 
 		 370 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  34.51 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  37.76 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  36.89 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  33.85 
 
 		 369 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  35.31 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  40.56 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  35.65 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0657  ABC-type transporter, permease component  38.87 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1268  transport system permease protein  40.47 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  39.33 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  35.89 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1070  transport system permease protein  39.73 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  41.44 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  38.28 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  39.07 
 
 		 336 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  37.81 
 
 		 345 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  37.5 
 
 		 371 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  39.44 
 
 		 322 aa  192  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3279  transport system permease protein  38.57 
 
 		 381 aa  192  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1136  FecCD transport family protein  41.2 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500551  normal  0.214464 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  37.35 
 
 		 355 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1121  transport system permease protein  41.46 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1755  heme transporter protein HuvC, transmembrane permease component  39.66 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00487431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  40.21 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  40.99 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  38.28 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  38.28 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  38.28 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.18 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0841  transport system permease protein  38.46 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  36.39 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  33.63 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  41.75 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  37.27 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  37.67 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  35.99 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>